Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA)

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Unité de Génétique Moléculaire Animale (UGMA) Powered By Docstoc
					UMR INRA 1061
               Unité de Génétique
               Moléculaire Animale
               (UGMA)

thèmes de
recherches >
               Glycobiologie
               et maladies à prions
               Glycobiologie et différenciation
               musculaire
               déterminisme génétique
               du développement musculaire
               déterminisme génétique
               des Qualités des Viandes
               Gènes de coloration de la robe
               et traçabilité raciale
               chez les bovins
               Génomique bovine

mots clés >    différenciation         muscle
               cellulaire              sNP
               évolution               Protéome
               Génétique moléculaire   Qtl
               Génomique               traçabilité
               Génotypage              transcriptome
               Glycosylation           modèles souris
               maladie à prions        et bovin
Unité de Génétique
Moléculaire Animale



ApplicAtions
indUstrielles
transcriptomique
                                        Les travaux de cette Unité Mixte de Recherche visent
Protéomique
                                        à approfondir la connaissance du génome bovin
séquençage d’AdN
                                        et de son fonctionnement pour mieux comprendre
détection et analyse de
                                        comment la régulation quantitative de l’expression des
polymorphismes génétiques
                                        gènes règle la formation des phénotypes (caractères)
Aide à la sélection d’animaux
                                        complexes. Deux thématiques principales sont
de races bouchères
                                        abordées. L’une concerne l’analyse du glycogénome
développement de marqueurs
génétiques de traçabilité raciale       sur le plan évolutif et fonctionnel ainsi que l’étude de
                                        sa contribution dans des processus physiologiques
                                        (différenciation de la cellule musculaire) et pathologiques
prestAtions
                                        (maladies à prions, inflammation). L’autre a trait à la
caractérisation, essai, tests
                                        génomique du muscle squelettique et de la coloration
                                        de la robe chez les bovins, dans le cadre de recherches
secteUrs d’ApplicAtion
                                        portant sur le déterminisme génétique lié à ces caractères.
Génomique bovine, Agronomie, santé
                                        Notre unité fait appel à des modèles cellulaires et
                                        animaux divers (bovins, souris, etc.) et intègre des
eqUipeMents /                           méthodes de la génétique moléculaire, la génomique
ressoUrces techniqUes                   et la biologie intégrative. Nos études exploitent :
Plateau technique de séquençage         • les données de la communauté scientifique sur
Plateau technique de transcriptomique   différents modèles animaux (la souris principalement),
Plateau technique de protéomique        • le séquençage du génome bovin et les SNP répertoriés
                                        pour les races bovines,
Pôle(s) de compétitivité auquel         • les données des programmes d’identification et de validation
le laboratoire est associé :
                                        de gènes candidats, de détection de QTLs, et de sélection,
Viandes et produits carnés
                                        • les plateaux techniques de l’IFR 145 « GEIST »
                                        et les dispositifs expérimentaux du département de
                                        Génétique Animale de l’INRA.
                                        L’Unité est complètement intégrée dans le dispositif
                                        de formation de l’Université de Limoges. Elle est au
                                        cœur d’un Master Professionnel de « Biotechnologie »
                                        et d’une Licence Professionnelle « Génétique
                                        et Développement de l’élevage ». Elle collabore
                                        étroitement avec les Universités de Clermont-Ferrand
                                        dans le cadre du Master Recherche « Génétique
                                        et Physiologie ». Enfin, elle assure une formation
                                        continue en génomique destinée aux professionnels de
                                        l’élevage.
                                                        UNIté de GéNétIQUe molécUlAIre ANImAle




INDICATEURS                               PARTENARIATS
(au 30 octobre 2008)
                                          Collaborations universitaires nationales actives :
enseignants-chercheurs : 14               Université de lille, Université Blaise Pascal clermont Fd, Université
chercheurs ePst ou ePIc : 2               d’Auvergne clermont Fd, Institut Pasteur Paris, INserm U602,
hdr : 6                                   Université de Paris sud XI
doctorants : 13
Projets ANr en cours : 4                  Collaborations universitaires internationales en cours :
Projet européen en cours : 1              Université de Pise (Italie)

                                          Coopérations industrielles nationales :
                                          Institut de l’élevage, UNceIA, Pôle de lanaud
VALORISATION
(2004 - 2008)                             Groupements d’intérêt scientifique (GIS) :
                                          - Pôle Viande
Nombre de brevets déposés : 1 en          - celeGeN (centre limousin d’exploitation du Génome Bovin)
copropriété
liste des entreprises créées issues des   Groupements de recherche (GDR) :
activités de recherche depuis 2000 :      Génie et Génomique des Glycosyltransférases
- Glycode sAs
- mêtis Biotechnologie
                                      PRODUCTION SCIENTIFIQUE
Unité de Génétique
                                      DE L’UNITÉ DE RECHERCHE
                                      (2004-2008)
Moléculaire Animale
                                      Nombre d’articles internationaux : 40
(UGMA)                                Autres : en 2007, dans la collection mini manuel dunod
                                      3 ouvrages : « Biologie moléculaire », « Biologie cellulaire », « Génétique ».
umr1061.unilim.fr

Faculté des sciences                  Publications et/ou brevets majeurs des 5 dernières années
et techniques
123 AV Albert thomas                  • Barret A., Forestier L., Deslys J.-P., Julien R., Gallet P.-F. Glycosylation-related
87060 lImoGes cedex                   gene expression in prion diseases. PrPsc accumulation in scrapie-infected Gt1
                                      cells depends on 1,4-linked GalNAc-4-SO4 hyposulfation. J. Biol. Chem., 2005,
FrANce
                                      280: 10516-10523.

Tél. (33) (0)5 55 45 76 77            • Brémaud L., Herrera-Mendez C.H., Pélissier P., Sentandreu M.A., Aubry L.,
Fax (33) (0)5 55 45 76 53             chambon c., delourme d., maftah A., levéziel h., ouali A. Purification of the
                                      skeletal muscle protein endopin 1B and characterization of the genes encoding
                                      Endopin 1A and 1B isoforms. FEBS Letters, 2006, 580: 3477-3484.
Institut d’appartenance               • Clop A., Marcq F., Takeda H., Pirottin D., Tordoir X., Bibé B., Bouix J., Caiment
Génomique, environnement, Immunité,   F, Elsen J.-M., Eychenne F., Larzul C., Laville E., Meish F., Milenkovic D., Tobin J.,
santé et thérapeutiques               charlier c., Georges m. A mutation revealing an illegitimate mirNA target site
(IFR 145 GEIST)                       in the myostatin gene is a Quantitative trait Nucleotide with major effect on
                                      muscularity in sheep. Nature Genetics, 2006, 38: 813-818.
Directeur                             • Girardot M., Guibert S., Laforêt M.-P., Gallard Y., Larroque H., Oulmouden
Abderrahman mAFtAh                    A. the insertion of a full-length Bos taurus lINe element is responsible for a
(abderrahman.maftah@unilim.fr)        transcriptional deregulation of the Normande Agouti gene. Pigment cell. res.,
                                      2006, 19: 346-355.
                                      • Loriol C., Dupuy F., Rampal R., Dlugosz M.A., Haltiwanger R.S., Maftah A.,
                                      Germot A. molecular evolution of protein o-fucosyltransferase genes and splice
                                      variants. Glycobiology, 2006, 16: 736-747.
                                      • Hamelin M., Sayd T., Chambon C., Bouix J., Bibé B., Milenkovic D., Levéziel
                                      h., Georges m., clop A., marinova P., laville e. differential expression of
                                      sarcoplasmic proteins in four heterogeneous ovine skeletal muscles. Proteomics,
                                      2007, 7: 271-280.
                                      • Loriol C., Audfray A., Dupuy F., Germot A., Maftah A. Only the first N-glycan
                                      of bovine o-fucosyltransferase 1 is critical for its solubility and activity. FeBs
                                      Journal, 2007, 274: 1202-1211.
                                      • Pélissier P., Delourme D., Germot A., Blanchet X., Becila S., Maftah A., Levéziel
                                      h., ouali A., Bremaud, l. An original serPINA3 gene cluster: elucidation of
                                      genomic organization and gene expression in the Bos taurus 21q24 region. Bmc
                                      Genomics, 2008, 9: 151.

                                      Brevet
                                      • Oulmouden, A., Julien, R., Laforêt, M.P. et Levéziel, H. (2003). Brevet 03-09161
                                      déposée aux noms conjoints de l’INrA et de l’Université de limoges. titre :
                                      « Utilisation du gène sIlVer pour l’authentification de l’origine raciale des
                                      populations animales et de leurs produits dérivés ». extension européenne Pct
                                      N° FR04/01952 du 22/07/04.