Lists of specific genes by myp59305

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									Spreadsheet1. Classification of qualitative expression patterns reported for unigenes

Classification      Expressed in all     A genome-specific     C genome-specific   B. rapa-specific
No. probes                       30793               3827                  4882                       142
No. unigenes                     27355               3427                  4424                       135
List of unigenes    AI352725             AI352729              AI352723            AT000762
                    AI352839             AI352931              AM056601            CA991864
                    AI352842             AM062577              AM056687            CB686305
                    AI352858             AM392215              AM056691            CD813580
                    AI352861             AM392215              AM056879            CD826198
                    AI352861             AM394344              AM056884            CD828796
                    AI352864             AM394776              AM056924            CN727321
                    AI352871             AT000459              AM057013            CX194443
                    AI352875             AT000710              AM057156            DN191610
                    AI352887             AT000759              AM057245            DN961661
                    AI352890             AT000794              AM057275            DN964516
                    AI352897             AT002068              AM057425            DN964826
                    AI352900             AT002068              AM057514            DV643329
                    AI352910             BG543646              AM057541            DY002437
                    AI352912             BG543678              AM057562            EE418473
                    AI352955             BG543961              AM057596            EE427081
                    AI352956             BG544446              AM057773            EE427949
                    AI352956             BG544446              AM057775            EE451851
                    AM056509             BQ704417              AM057911            EE505105
                    AM056697             BQ704543              AM057967            EE505646
                    AM056724             BQ704897              AM058214            EE508896
                    AM056728             BQ704951              AM058224            EE521398
                    AM056768             BQ790992              AM058340            EE521398
                    AM056777             BQ791200              AM058441            EE530144
                    AM056827             CA991524              AM058562            EE544434
                    AM056853             CA991554              AM058674            EE549175
                    AM056872             CA991555              AM058680            EE559076
                    AM056906             CA991606              AM058729            EE562182
                    AM056911             CA991618              AM058753            EE568223
                    AM056955             CA991699              AM058773            EE568791
                    AM056957             CA991759              AM058900            ES898173
                    AM056962             CA991802              AM058969            ES911615
                    AM056965             CA991892              AM059112            ES911615
                    AM056970             CA991969              AM059112            ES922527
                    AM056970             CA992033              AM059203            ES968203
                    AM056986             CA992285              AM059298            EV007978
                    AM056986             CB686157              AM059386            EV017610
                    AM057018             CB686270              AM059656            EV072260
                    AM057025             CB686270              AM059676            EV081616
                    AM057102             CB686336              AM059702            EV107499
                    AM057150             CD812594              AM059713            EV124854
                    AM057163             CD813498              AM059743            EV180249
                    AM057167             CD813729              AM059869            EV214797
                    AM057181             CD814402              AM060018            EX025054
                    AM057182             CD814561              AM060040            EX035837
                    AM057188             CD820618              AM060155            EX043555
                    AM057199             CD824295              AM060217            EX043946
                    AM057250             CD826627              AM060240            EX056651
                    AM057292             CD826639              AM060533            EX087642
                    AM057292             CD826832              AM060640            EX089464
                    AM057378             CD827468              AM060687            EX089464
AM057546   CD830589   AM060869   EX092440
AM057695   CD831618   AM060869   EX093402
AM057733   CD831618   AM061032   EX094817
AM057748   CD831788   AM061091   EX094817
AM057770   CD833454   AM061443   EX097077
AM057799   CD833454   AM061508   EX101238
AM057804   CD833617   AM061512   EX111691
AM057806   CD834702   AM061524   EX120608
AM057816   CD834894   AM061598   EX126933
AM057953   CD834894   AM061609   EX127376
AM057995   CD835236   AM061627   EX129376
AM058003   CD835236   AM061636   EX129417
AM058042   CD835579   AM061726   EX130439
AM058083   CD836799   AM061989   EX131027
AM058165   CD836916   AM062052   EX135464
AM058165   CD841978   AM062062   EX136536
AM058205   CD843200   AM062116   EX138357
AM058226   CD843240   AM062121   JCVI_10849
AM058247   CK991428   AM062300   JCVI_12320
AM058267   CK991433   AM062389   JCVI_12702
AM058293   CK991448   AM062424   JCVI_14029
AM058298   CN727040   AM062424   JCVI_14400
AM058313   CN727572   AM062446   JCVI_15398
AM058403   CN727611   AM062512   JCVI_16558
AM058461   CN728309   AM062534   JCVI_16807
AM058489   CN728309   AM385154   JCVI_17006
AM058621   CN729979   AM385398   JCVI_18478
AM058732   CN729994   AM385398   JCVI_18846
AM058765   CN733446   AM385498   JCVI_19602
AM058801   CN737506   AM385523   JCVI_20162
AM058810   CN825869   AM385580   JCVI_22143
AM058812   CN825869   AM385789   JCVI_22414
AM058833   CN827568   AM385820   JCVI_22532
AM058835   CN831008   AM385821   JCVI_22706
AM058964   CO749357   AM385895   JCVI_22956
AM059008   CO749390   AM385902   JCVI_22974
AM059023   CO749471   AM386005   JCVI_23044
AM059057   CO749560   AM386005   JCVI_25004
AM059057   CO749865   AM386330   JCVI_25734
AM059109   CO749896   AM386428   JCVI_25766
AM059155   CO749910   AM386723   JCVI_26149
AM059206   CO749958   AM386723   JCVI_26171
AM059206   CO749985   AM386917   JCVI_2659
AM059225   CO750304   AM387083   JCVI_26780
AM059263   CO750356   AM387214   JCVI_26996
AM059296   CO750356   AM387276   JCVI_27515
AM059339   CO750485   AM387277   JCVI_27515
AM059362   CV432088   AM387297   JCVI_27609
AM059362   CV432094   AM387365   JCVI_27613
AM059437   CV432321   AM387452   JCVI_28168
AM059460   CV432323   AM387553   JCVI_29315
AM059467   CV432323   AM387558   JCVI_29516
AM059565   CV432446   AM387558   JCVI_29775
AM059577   CV432477   AM387592   JCVI_30966
AM059577   CV432477   AM387806   JCVI_31538
AM059611   CV432495   AM387806   JCVI_31878
AM059625   CV432663   AM387835   JCVI_32163
AM059641   CV432960   AM387945   JCVI_32400
AM059662   CV433630   AM388033   JCVI_32614
AM059682   CV433770   AM388538   JCVI_35521
AM059731   CV433904   AM388779   JCVI_35825
AM059821   CV434029   AM388898   JCVI_35864
AM059885   CV544657   AM388906   JCVI_35879
AM059909   CV544844   AM389056   JCVI_36365
AM059970   CV544978   AM389072   JCVI_37797
AM059970   CV545911   AM389081   JCVI_38037
AM060041   CV546035   AM389172   JCVI_38091
AM060140   CV546570   AM389242   JCVI_38363
AM060140   CV546762   AM389311   JCVI_39348
AM060227   CV650659   AM389314   JCVI_39480
AM060363   CV650679   AM389343   JCVI_39513
AM060364   CV650709   AM389512   JCVI_40633
AM060445   CX187669   AM389721   JCVI_41553
AM060457   CX188054   AM389775   JCVI_41560
AM060464   CX188098   AM389851   JCVI_42008
AM060516   CX188322   AM389904   JCVI_42506
AM060532   CX188538   AM390021   JCVI_4685
AM060744   CX188629   AM390247   JCVI_4830
AM060805   CX189255   AM390247   JCVI_5055
AM060805   CX189362   AM390284   JCVI_5406
AM060878   CX189649   AM390334   JCVI_6810
AM060929   CX189985   AM390393   JCVI_7128
AM060929   CX190081   AM390423   JCVI_7808
AM060984   CX190739   AM390428   JCVI_8263
AM060990   CX190870   AM390432   JCVI_8263
AM060994   CX191192   AM390432   JCVI_8823
AM061024   CX192758   AM390602   JCVI_9993
AM061024   CX193227   AM390680   JCVI_9993
AM061074   CX193488   AM390680   RC_AT000583
AM061104   CX194219   AM390723   RC_EX041930
AM061109   CX194782   AM390891   RC_JCVI_23435
AM061187   CX195294   AM391309
AM061211   CX195299   AM391313
AM061211   CX195565   AM391436
AM061214   CX196139   AM391482
AM061214   CX266197   AM391491
AM061289   CX266312   AM391549
AM061328   CX266540   AM391561
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AM061442   CX270402   AM391669
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RC_H07713
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RC_H74724
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RC_JCVI_24851
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RC_JCVI_27028
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RC_JCVI_30027
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RC_JCVI_40634
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RC_L46475
RC_L46537
RC_T18349
RC_T18361
T18374
T18376
T18377
B. oleracea-specific Diploid-specific       Tetraploid-specific B. napus 1-specific    B. napus 2-specific
                 19                     0                     12                   2                      4
                 19                     0                     12                   2                      4
AM388179                                    CD821790             JCVI_15826            EE473767
CX193946                                    CN727581             JCVI_18923            EV001239
EE446162                                    CX192644                                   JCVI_34662
EE512033                                    EE563813                                   JCVI_38330
EE533835                                    EL590055
ES949270                                    ES901313
EV121300                                    EV013537
EV125358                                    EV209435
EV175580                                    EX071313
EX065318                                    JCVI_28604
JCVI_12316                                  JCVI_4955
JCVI_2096                                   JCVI_5528
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JCVI_29655
JCVI_37531
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RC_JCVI_42574
B. rapa plus B. napus 1 B. rapa plus B. napus 2 B. oleracea plus B. napus 1
                       1                       3                            2
                       1                       3                            2
RC_ES979096              AM388472                AM058815
                         JCVI_240                EV092683
                         JCVI_41341
B. oleracea plus B. napus 2       Diploids plus B. napus 1 Diploids plus B. napus 2
                              2                           0                        0
                              2                           0                        0
JCVI_31171
JCVI_35756

								
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