Influence of Frameshift Mutations in Colorectal Cancer with by pptfiles

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									Supplement 1. Patient characteristics and frameshift mutations.
Pts   Age                                                                      Genes with frameshift mutation                                                                 FMN   Site   Dif    L     TNM           TILs         H    R
            ACVR2   TAF1   ASTE1   TGFBR   CASP   SEC63   MSH3   AIM   PTEN7   PTEN8 PRDM2 (1) PRDM2 (2)        MBD4   OGT   TCF4   HNF1   IGFR2   RAD50   BAX   MSH6   APC                             stage   TC    IF   Total
 1    89            B              2       5                     2                                                                  A                      NA                 16     R     Mod    12     II     0,8   1,1  0,95     0    1
 2    93                                                                                              NA                      NA     NA                    NA                  8     R     Poor    8    III     2,7   3,6  3,13     0    0
 3    81                                                                                                                                                                      12     L     Well    5    NA      1,9   2,2  2,04     0    0
 4    53                                                         NA             NA         NA         NA               NA     NA                    NA                   NA    7     R     Well    4    III     1,9   1,7  1,79     1    1
 5    72                                                                                                                                                                      13    RC     Mod    NA    III     5,6    8   6,79     0    0
 6    70                                                                                                                                                                       6     R     Well    1     II     NA    NA    NA      0    0
 7    70                                                                                                                                                                      16     R     Well   10    III     1,6   2,4    2      0    0
 8    79                                                                                                                                                   NA                  8     R     Poor   16     II      6    8,1  7,03     0    0
 9    43                                                         NA             NA         NA         NA                      NA                    NA                   NA    3    NA      NA    NA    NA      1,7   1,2  1,45    NA    1
10    68                                                                                                                                                                      11     L     Mod     9     II     1,8    4   2,88     0    0
11    46                                                                                                                                                                       7     R     Well    5     II     1,6   7,3  4,44     1    0
12    52                                                                                              NA                                                                      12     L     Well    8     II     0,6   0,7  0,66     1    0
13    73                                                                                                                                                                       8     R     Well   11     II     1,1   0,9  0,99     0    1
14    86                                                                                                                                                                       7     R     Well    8    III     0,3   1,7  1,02     0    0
15    77                                                                                                                                                                       9     R     Well    6     II     2,2   1,8    2      0    0
16    71                                                                                                                                                                      18     R     Poor    9    III     3,5   4,9  4,21     0    0
17    66                            NA                           NA             NA         NA         NA               NA     NA                    NA     NA     NA     NA    4     R     Mod     2     II     1,3   2,5  1,86     0    0
18    59                                                                                                                                                                       7     R     Well    4     II     NA    NA    NA      1    0
19    84                                                                                                                                                                      15     R     Poor   13     II      1    2,9  1,92     0    0
20    84                                                                                                                                                                      13     R     Poor    9     II     1,4   3,6   2,5     0    0
21    31                                                                                                                                                                       3     L     Well   10    III     0,2   0,8  0,52     1    1
22    52                                                                                                                                                                       2     R     Bien   11    III     1,5   1,1  1,29     1    0
23    48                                                                                                                                                                       8     L     Mod    NA    III     1,5   2,3  1,89     1    0
24    38                                                                                                                                                                       7    RC     Well   2,5   III     NA    NA    NA     NA    0
25    95                                                                                                                                                                      10     R     Mod     7     II     1,7    2   1,86     0    1
26    51                                                                                                                             NA                    NA                  2    RC      NA    0,8    II     NA    NA    NA     NA    0
27    51                                                         NA                        NA         NA               NA     NA     NA             NA     NA     NA     NA    0    RC      NA    0,8    II     NA    NA    NA     NA    0
28    36                                                                                   NA         NA               NA     NA                                               4     L     Well    5     II     NA    NA    NA      1    0
29    47     NA                                    NA                                                                                       NA                                 5     R     Mod    1,9   III     2,2   1,3  1,73     1    0
30    74                                                                                                                                                                      12     R     Poor    6     II     2,9   4,5  3,71     0    0
31    41                                                                                                                                                                       6     R     Well    7     II     0,9   1,2  1,09     1    0
32    90                                                                                                                                                                       9    RC     Well   6,5    II     4,5   4,7   4,6     0    0
33    85                                                                                                                                                   NA                 14     R     Well    3     II     2,6   5,7  4,14     0    0
34    67                                                                                                                                                                      11     R     Well    8     II     2,8   3,4  3,11     0    0
35    91                                                         NA                                   NA               NA     NA     NA                    NA            NA    8     R     Well   13     II     0,9   1,7   1,3     0    0
36    32                                                                                                                                                                      11     R     Well    8     II     NA    NA    NA      0    0
37    84                                                                                                                                                                      11     R     Mod     6    III      1    3,2  2,13     0    0
38    59                                                                                                                                                                       6     L      NA     7     II     1,1    2   1,54     0    0
39    34                                                                                                                                                                       8     R      NA    NA    III     NA    NA    NA      1    0
40    64                                                                                                                                                                       6     R     Well    5     II     1,5   0,9  1,18     1    0
41    62                                                                                              NA                      NA     NA                                       10     R     Well    8     II     1,1   2,3   1,7     1    0
42    85                                                                                                                                                                      11     L     Well    5    III     3,5   6,9   5,2     0    1
43    87                                                                                                                                                                      13     R     Well   7,2   III     9,6   7,8  8,72     0   NA
44    60                                                         NA                                                                  NA                                        3    NA      NA    NA    NA      1,2   1,3  1,23     1   NA
45    60                    NA                                                                                                                             NA                  5    RC     Well   5,5    II     1,8    1   1,41     1    0
46    74                                                                                                                                                                       9     R     Well    3     II     1,6   5,8  3,69     0    0
47    65                                                         NA                                                                                                           11    NA      NA    NA     II     2,1   2,4  2,29     1    0
48    82                                                                                                                                                                      11     L     Mod    10     II     2,1   2,6  2,36     0    0
49    83                                    NA                                                        NA                      NA     NA                    NA                  6     R     Mod    7,5   III     1,6   1,9  1,77     0    0
50    85                                                                                                                                                                       7     R     Bien    1     II     1,5    3   2,25     0    0
51    83                                                         NA                                   NA                      NA     NA                                  NA    7     R     Poor   13    III     2,2   5,2   3,7     0    0
52    88                                                                                                                                                                      17     L     Poor   7,5   III      3    4,6  3,81     0    0
53    40                                                                                                                                                   NA                 10     R     Well   NA    III     NA    NA    NA      0    1
54    64                                                                                                                                                                       7     R     Poor   10    III     1,5    3   2,25     0    0
55    80                                                                                                                                                   NA                 14     L     Well   10     II     0,6   1,4  1,01     0    0
56    42                                                                                              NA                                                                       6     L     Well    8     II     2,5   3,4  2,96     0    0
57    76                                                                                                                                                                       7     R     Well    7    III     1,1   4,2  2,68     0    1
58    39                                                                                                                                                                      13     R     Well   NA     II     4,4   4,1  4,21     0    0
59    53                                                                                                                             NA                                        9     R     Poor   4,5    II     2,6   3,7  3,12     0    0
60    60                                                                                                                                                                       6     R     Well   1,2    II     1,9   4,1  2,99     1    0
61    40                                                         NA             NA         NA         NA                      NA                    NA                   NA    6     R      NA    NA    NA      0,5   0,7   0,6     1    0




                                                                                                                                                                                                                                             1
NA: not available for analysis, FMN : frameshift mutation number, Pts: patients,
Frameshift mutation:      = no mutation,    = mutation in some of the malignant cells, = mutation in all malignant cells
PTEN7: PTEN exon 7, PTEN8: PTEN exon 8, PRDM2 (1) = (A)8 polyA tract and PRDM2 (2) = (A)9 polyA tract
RC: rectum, L: left colon, R: right colon,
Dif: differentiation, mod: moderate, L: lenght
TILs: tumour infiltrating lymphocytes, TC: tumor centre, IF: invasion front
H: Heriditary Non Polyposis Colorectal Cancer, R: recurrence




                                                                                                                           2

								
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