Sensibilidad_ Especificidad_ SS y otras 2012.xlsx

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Sensibilidad_ Especificidad_ SS y otras 2012.xlsx Powered By Docstoc
					                                               Especifi y Sensi

Ejemplo

Tenemos el siguiente ensayo :                                     Detección de partículas virales X

                                 Con los siguientes resultados                                 Nueva
                                                                                               Prueba
Estandard Oro                    Prueba :         Western Blot o PCR

                                 Muestras analizadas                       589
                                 Resultados positivos                      125
                                 Resultados negativos                      464



Prueba de Laboratorio            A

                                 Muestras analizadas                       589
                                 Resultados positivos                      115                    Prueba
                                 Resultados negativos                      474                      A

                                 De los 115 +, 15 no son del grupo de los 125 positivos
                                 De los 474 negativos, 25 no eran negativos


Prueba de Laboratorio            B
                                 Muestras analizadas                       589
                                 Resultados positivos                      145
                                 Resultados negativos                      444
                                                                                                  Prueba
                                                                                                    A
                                 De los 145 +, 40 no son del grupo de los 125 positivos
                                 De los 444 negativos, 20 no eran negativos


Prueba de Laboratorio            C
                                 Muestras analizadas                       589
                                 Resultados positivos                      180
                                 Resultados negativos                      409
                                                                                                  Prueba
                                                                                                    A
                                 De los 180 +, se detectan 124 positivos de los 125
                                 De los 409 negativos, 1 no eran negativo




¿Cual prueba voy a seleccionar para su la detección de estas partículas virales?
                                Prueba A          Prueba B      Prueba C
                                                   Página 1
                                              Especifi y Sensi
Análisis de Sensibilidad                 80.00%        84.00%        99.20%
Análisis de Especificidad                96.77%        91.38%        87.93%                               100.00%
PVP                                      86.96%        72.41%        68.89%
PVN                                      94.73%        95.50%        99.76%
EFICIENCIA                               93.21%        89.81%        90.32%                               95.00%
PREVALENCIA                              21.22%        21.22%        21.22%
                                                                                                          90.00%


Si estoy en programa de producción de pruebas de laboratorio para detección                               85.00%
de un virus patogénico y de gran morbilidad o mortalidad, la Prueba C sería




                                                                                             % obtenido
la que seleccionaría.
                                                                                                          80.00%
Pues lo peor que se puede generar es dar por sano a una persona cuando en
realidad está enferma.
                                                                                                          75.00%
Según el enfoque de la prueba debería buscarse el óptimo de sensibilidad y
especificidad para lograr el mejor resultado posible.
                                                                                                          70.00%


                                                                                                          65.00%


                                                                                                          60.00%
                                                                                                              Prueba A




ROC                             ANALISIS


                                Prueba A         Prueba B     Prueba C
Análisis de Sensibilidad                    0.80         0.84         0.99
Análisis de Especificidad                   0.97         0.91         0.88


SENSIBILIDAD                                0.8           0.84          0.992
1-ESPECIFICAD                      0.032327586      0.0862069     0.12068966




                                                         0.992    0.12068966
                                                          0.84     0.0862069
                                                            0.8   0.03232759

                                                          99.9    87.8458704    12.1541296
                                                          99.2    87.9310345    12.0689655
                                                            84    91.3793103    8.62068966
                                                            80    96.7672414    3.23275862
                                                  Página 2
Especifi y Sensi
              70   97.1713362   2.82866379
              60    97.575431   2.42456897
              50   97.9795259   2.02047414
              40   98.3836207   1.61637931
              30   98.7877155   1.21228448
              20   99.1918103   0.80818966
              10   99.5959052   0.40409483
               5   99.7979526   0.20204741




   Página 3
                                           Especifi y Sensi




                     Estandard Oro
              Positivos     Negativos
Positivos     A             B
Negativos     C             D                                 S = A / (A + C)
                                                              A = verdaderos positivos
                                                              C = falsos negativos
Cuadro 1

                     Estandard Oro
              Positivos     Negativos
Positivos               100           15        115             Sensibilidad   80.00%
Negativos                25          449        474
                        125          464        589




Cuadro 2

                     Estandard Oro
              Positivos     Negativos
Positivos               105           40        145             Sensibilidad   84.00%
Negativos                20          424        444
                        125          464        589



Cuadro 3

                     Estandard Oro
              Positivos     Negativos
Positivos               124           56        180             Sensibilidad   99.20%
Negativos                 1          408        409
                        125          464        589




           Sensibilidad VS Especificidad en Pruebas de Laboratorio

                                              Página 4
                  Especifi y Sensi


100.00%


95.00%


90.00%


85.00%


80.00%                           Análisis de Sensibilidad
                                 Análisis de Especificidad

75.00%


70.00%


65.00%


60.00%
    Prueba A   Prueba B                                      Prueba C




                      Página 5
Especifi y Sensi




   Página 6
                                   Especifi y Sensi




A + C)                 E = D / (B + D)        PVP

aderos positivos       D = verdaderos negativo
s negativos            B = falsos positivos


           100     Especificidad    96.77%            449   PVP
           125                                        464




           105     Especificidad    91.38%            424   PVP
           125                                        464




           124     Especificidad    87.93%            408   PVP
           125                                        464




                                      Página 7
Especifi y Sensi




   Página 8
Especifi y Sensi




   Página 9
                      Especifi y Sensi




A / A+B             PVN         D/ C +D




     86.96%   100   PVN                  94.73%   449
              115                                 474




     72.41%   105   PVN                  95.50%   424
              145                                 444




     68.89%   124   PVN                  99.76%   408
              180                                 409




                          Página 10
Especifi y Sensi




  Página 11
Especifi y Sensi




  Página 12
                               Especifi y Sensi




EFICIENCIA A+D/A+B+C+D




EFICIENCIA     93.21%    549
                         589




EFICIENCIA     89.81%    529
                         589




EFICIENCIA     90.32%    532
                         589




                                 Página 13
                                              error estandard

Ejemplo

Tenemos el siguiente ensayo :                                Detección de partículas virales X

                                Con los siguientes resultados                             Nueva
                                                                                          Prueba
Estandard Oro                   Prueba :      Western Blot o PCR

                                Muestras analizadas                     589
                                Resultados positivos                    125
                                Resultados negativos                    464



Prueba de Laboratorio           A

                                Muestras analizadas                     589
                                Resultados positivos                    115                  Prueba
                                Resultados negativos                    474                    A

                                De los 115 +, 15 no son del grupo de los 125 positivos
                                De los 474 negativos, 25 no eran negativos


Prueba de Laboratorio           B
                                Muestras analizadas                     589
                                Resultados positivos                    145
                                Resultados negativos                    444
                                                                                             Prueba
                                                                                               A
                                De los 145 +, 40 no son del grupo de los 125 positivos
                                De los 474 negativos, 20 no eran negativos


Prueba de Laboratorio           C
                                Muestras analizadas                     589
                                Resultados positivos                    180
                                Resultados negativos                    409
                                                                                             Prueba
                                                                                               A
                                De los 180 +, se detectan 124 positivos de los 125
                                De los 40+ negativos, 1 no eran negativo




                                Prueba A      Prueba B       Prueba C
                                                 Página 14
                                                error estandard
Análisis de Sensibilidad              80.00%         84.00%          99.20%
EEP                                     0.016          0.015           0.004
IC
rango superior (+)                    83.23%         86.96%          99.92%
rango inferior (-)                    76.77%         81.04%          98.48%

Se tomo un intervalo de confianza de 95%, o Zalfa igual a 1.96


¿Qué sucede si aplicamos un intervalo de confianza con 99%?
Zalfa=                                  2,576

Tendría la prueba C un intervalo aceptable?




ROC                              ANALISIS


                                 Prueba A     Prueba B     Prueba C
Análisis de Sensibilidad                 0.80         0.84         0.99
EEP                                      0.02         0.02         0.00


SENSIBILIDAD                              0.8           0.84            0.992
1-ESPECIFICAD                     0.98351829     0.98489426       0.99632935




                                                       0.992      0.99632935
                                                        0.84      0.98489426
                                                          0.8     0.98351829

                                                        99.9 -0.33598981         100.33599
                                                        99.2 0.36706517         99.6329348
                                                          84 1.51057394         98.4894261
                                                          80 1.64817129         98.3518287
                                                  Página 15
error estandard
          70      13.9421499   86.0578501
          60      26.2361285   73.7638715
          50      38.5301071   61.4698929
          40      50.8240856   49.1759144
          30      63.1180642   36.8819358
          20      75.4120428   24.5879572
          10      87.7060214   12.2939786
           5      93.8530107   6.14698929




  Página 16
                                         error estandard




                   Estandard Oro
            Positivos     Negativos
Positivos   A             B
Negativos   C             D




Cuadro 1

                   Estandard Oro
            Positivos     Negativos
Positivos             100           15       115           Sensibilidad   80.00%
Negativos              25          449       474
                      125          464       589

                                                           n*p=            471.2
                                                           n*(1-p)=        117.8

Cuadro 2

                   Estandard Oro
            Positivos     Negativos
Positivos             105           40       145           Sensibilidad   84.00%
Negativos              20          424       444
                      125          464       589



Cuadro 3

                   Estandard Oro
            Positivos     Negativos
Positivos             124           56       180           Sensibilidad   99.20%
Negativos               1          408       409
                      125          464       589




                                           Página 17
     error estandard




((




       Página 18
error estandard




  Página 19
                                     error estandard




                                                        1.96
                                                          50
                                                        0.05
                                                 0.00707107
7,07106781186548                                 0.01385929




                   Error estandard de la proporción
                   EEP



        100                      P=                      0.80    IC
        125                      (1-P)                     0.2
                                 N=                       589
                                 EEP=                 0.0165
                                 IC              0.03230416
                                 Zalfa=                  1.96
                                           95%




        105                      P=                       0.84
        125                      (1-P)                    0.16
                                 N=                        589
                                 EEP=                  0.0151
     494.76
      94.24




        124                      P=                       0.99
        125                      (1-P)                  0.008
                                 N=                        589
                                 EEP=                  0.0037




                                          Página 20
error estandard




  Página 21
error estandard




  Página 22
                          error estandard




Maximo      Mínimo
     83.23%      76.77%
mas - menos       3.23%




                                   ((




                            Página 23
error estandard




  Página 24
error estandard




  Página 25
error estandard




  Página 26
                       CURVAS Y REPETIBILIDAD INTRA IN



    REPETIBILIDAD INTRA ENSAYO E INTERENSAYO

                       MEDICIONES
    CURVAS U/ML                   1           2          3 PROMEDI0 DESV
1                 10          0.120       0.111      0.103      0.111  0.0085049
2                 20          0.253       0.310      0.283      0.282 0.02851315
3                 30          0.450       0.401      0.421      0.424 0.02463737
4                 40          0.612       0.651      0.666      0.643 0.02787472
5                 50          0.820       0.785      0.799      0.801 0.01761628
6                 60          0.980       0.890      0.901      0.924 0.04909515



    SEGUNDA MEDICION UNA SEMANA DESPUÉS

                       MEDICIONES
    CURVAS U/ML                   1           2          3 PROMEDI0 DESV
1                 10          0.132       0.122      0.113      0.122 0.00935539
2                 20          0.278       0.341      0.311      0.310 0.03136447
3                 30          0.495       0.441      0.463      0.466 0.02710111
4                 40          0.673       0.716      0.733      0.707 0.03066219
5                 50          0.902       0.864      0.879      0.881 0.01937791
6                 60          1.078       0.979      0.991      1.016 0.05400466




                                                                           1.200


    CURVAS U/ML        MEDICION T0 MEDICON B                               1.000
1                 10          0.111     0.122        -0.011   0.00787246
2                 20          0.282     0.310        -0.028   0.01994041   0.800
3                 30          0.424     0.466        -0.042   0.02998133
4                 40          0.643     0.707        -0.064   0.04546697   0.600
5                 50          0.801     0.881        -0.080   0.05666282
6                 60          0.924     1.016        -0.092    0.0653131   0.400


                                                                           0.200


                                                                           0.000
                                                                                   10




                                  Página 27
                                CURVAS Y REPETIBILIDAD INTRA IN


              1.200




CV%
 7.63913223   1.000
 10.1110478
 5.81070047
 4.33510416
 2.19837109   0.800
 5.31524494



              0.600




              0.400




              0.200




              0.000
                      10                      20                  30




                                                    MEDICION T0
                                                    MEDICON B




     20       30           40         50           60




                                           Página 28
                     CURVAS Y REPETIBILIDAD INTRA IN




y = 0.1517x
R² = 0.9829




              1
              2
              3
              PROMEDI0
              Linear (2)




    40                     50                  60




                                Página 29
                              CV, Y CONTROL CALIDAD
                                                                               RANGOS
                 VALORES DE REFERENCIA                                       10 (9,5-10,5)
                                                                             20 (18,5-22,5)



                                                   MEDICIONES
               VALORES DE
               REFERENCIA RANGOS                              1              2              3
LAB A        1           10 (9,5-10,5)                    9.000          9.543         10.542
             2           20 (18,5-22,5)                  18.500         19.500         19.999

                                 RANGOS                       1              2              3
LAB B        1                 10 (9,5-10,5)             10.000         10.100         10.230
             2                 20 (18,5-22,5)            19.500         19.890         20.000




                 El laboratorio A, tendría acierto sobre el valor de la prueba incógnita, pero estaría violando las Re
                 ¿Qué otras opiniones o comentarios podemos generar?

                 reglas de Westgard


                               11
        3S                  10.75
        2S                   10.5                                                      10.542
        1S                  10.25
                               10
        1S                   9.75
        2S                    9.5                                        9.543
        3S                   9.25
                                9                         9.000




                                       Página 30
                                                    CV, Y CONTROL CALIDAD
             DESV            2S                        3S
                      0.25           0.5                      0.75
                       0.5             1                       1.5




                         5             6           7             8             9         10 PROMEDI
                     9.800        10.510       9.900        10.560         9.870      9.999      9.969
                    21.111        22.516      19.900        23.001        22.102       20.5     20.792

                         5             6           7             8             9         10 PROMEDI
                    10.252        10.001      10.500         9.989         9.870      9.999     10.105
                      19.8          19.9      21.000          20.1          20.5         21     20.188




ógnita, pero estaría violando las Reglas de WESTGARD en cuando a control de calidad




                                  10.510                    10.560

                                               9.900                       9.870      9.999
                     9.800




                                                             Página 31
                                        CV, Y CONTROL CALIDAD




                             alfa                      1.96




DESV           CV%           ERR            IC              Valor max    Valor min
       0.517         5.182          0.163             0.320       10.290        9.649
       1.504         7.235          0.476             0.932       21.724       19.860

DESV           CV%           ERR            IC                Valor max    Valor min
       0.192         1.901          0.061             0.119         10.224        9.986
       0.531         2.630          0.168             0.329         20.517       19.859




                                                 ((




                                                  Página 32

				
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