Docstoc

Mikroorganismoen zitoplasma eta osaera

Document Sample
Mikroorganismoen zitoplasma eta osaera Powered By Docstoc
					Zitoplasma eta bere osaera
  Material genetikoa (nucleoide).
    Kromosoma. Plasmidoak.

                                         Juan Arbulu
                         http://www.arizmendipro.eu
                                 juarbulu@gmail.com
                                            @jarbulu
   Ziktoplasma eta bere osaera
• Prokarioten zitoplasma sistema koloidal bat da:
  – Fase dispertsailea: ura eta hainbat sustantziak
    disoluzioan (zitosola)
  – Fase dispertsoa: makromolekulak eta partikula
    supramolekularrak
• Bere baitan du:
  – Material genetikoa: kromosoma (eta plasmidoak)
  – Erribosomak
  – Inklusioak eta organuloak (ez guztietan)
 Bazilo baten zitoplasmaren itxura

                         Zitoplasmaren
Erreserba granuloa
                         zati handienak
                         itxura granularra
                         du erribosomen
  Nukleoidea             eraginagatik




          Mesosoma
               Nukleoidea
• Prokarioten DNA ez dago mintzez
  inguraturik
• Zitoplasmaren alderdi baten biltzen da,
  nukleoide izena hartzen duelarik
• Genomaren osaera da:
  – Gehienetan kromosoma bakar bat
  – Batzutan, plasmidoak ere agertzen dira
  Prokariotetako kromosoma: osaera
          kimikoa eta egitura
• Kromosoma isolatuen osaera
  – %60 DNA
  – %30 RNA
  – %10 Proteinak
• Gehienetan kromosoma bakarra eta zirkularra,
  kobalenteki itxita
• Haploidia, baina bakterioa bizkor hazten bada
  kromosomaren kopiak egon daitezke aldi berean
     Prokarioten ohiko kromosomen
             salbuespenak
• Borrelia: kromosoma lineala, muturrak itxita
  dituelarik
• Streptomyces: kromosoma lineala muturretan
  errepikatutako sekuentziak dituelarik
• Bi kromosoma edo dituzten bakterioak
  – Rhodobacter, Vibrio, Leptospira, Brucella: bi
    kromosoma linealak
  – Sinorhizobium meliloti: hiru kromosoma zirkularrak
  – Burkholderia cepacia: 2-4 kromosoma
  – Agrobacterium tumefaciens: 1 lineala eta 1 zirkularra
     Kromosomaren tamaina
• Oiko bakterioak: 3000-5000 kpb
  – Adb.: Escherichia coli (4700 kpb)
• Bakteria txikiak: 700-1000 kpb
  – Adb.: Mycoplasma genitalium (700 kpb)
• Ziklo konplexuak dituzten bakteriak: 12000
  kpb
  – Adb.: Aktinomizetoak, zianobakterioak
     Kromatina eta kromosomaren
             antolaketa
• Watson-Cricken erako DNA helize bikoitza
• Negatiboki biribilkatuta, bi entzimen
  eraginagatik:
  – DNA girasa (topoisomerasa-II) superhelize
    negatiboak sartzen ditu
  – DNA topoisomerasa-I (superhelize negatiboa
    erlxatu egiten du)
DNAren superhelize negatiboa
• DNAren girasak superhelize negatiboa eragiten du.
• Ekintza bakoitzean kate bietan eten bat egiten du eta
  bertatik helize bikoitza pasatzen du, ondoren zegoen
  etena berriro itxiz
Escherichia coli-n agertzen diren gune
          superbiribilkatuak

• Escherichia coli-n 50 gune edo bukle
  superbiribilkatuak daude.
• Bukle bakoitza DNAri lotutako proteina
  berezi batzuk mantentzen dituzte.
• Bukle bakoitza egiturazko proteina batzuei
  lotuta daude, DNAri elkartzen direnean
  “kromatina” eratzen dutelarik.
Escherichia coli-ren bukleak
        Eubakterioen kromatinaren
           egiturazko proteinak
• HU: histonen antzerako proteina basikoak
  – Biraketa txikia duten DNA zatiei lotzen zaie
    espezifikotasunik gabe, biraketa handiagoa duten
    bukleak eratuz
  – DNAren konponketan, birkonbinazioan eta espresio
    genikoan parte hartzen du
• IHF
  – 13 pb-ko sekuentziari lotzen zaio era espezifikoan
  – DNA zati desberdinetan biraketa handiak eragiten
    ditu
  – Gene batzuren espresioan eta birkonbinazio
    espezifikoan parte hartzen du
Plasmidoa: definizioa eta kontzeptu
            orokorrak
• Plasmidoak: kromosoma kanpo dauden
  elementu genetikoak euren burua erriplikatzeko
  gai direnak
• Gehienak DNAzkoak dira c.c.c.
• Episomak: bakterioaren kromosoman txertatu
  daitezken plasmikdoak
• Tamaina: 2 kb-tik >1000 kb-rano
    Plasmidoak kodifikatutako
         fenotipo batzuk
• Antibiotikoekiko erresistentzia (R plasmidoak)
• Metal hastunekiko erresistentzia (Adb., Hg-ri)
• Birulentzia (toxinak, ehunen inbasioa, etab.)
• Bakteriozinen ekoizpena
• Sideroforoen ekoizpena
• C iturri ordezkoen erabilera
• Agrobacterium-en plasmidoak: tumoreen
  indukzioa landareetan (Ti A. tumefaciens-rena)
• Rhizobium-en plasmidoak: lekadunekin sinbiosia
  eta nitrogenoaren finkapena
     Plasmidoen erreplikazioa
• Erreplikatzeko gaitasuna izan arren
  ostalariaren herremintak behar izaten ditu
  bera egiteko, oriV
• Erreplikazio ereduak
  – Theta-erako erreplikazioa
     • Norantza bakarrekoa
     • Bi norantzetakoa
  – Sigma-erako erreplikazioa (zirkulu birakorra)

				
DOCUMENT INFO
Shared By:
Stats:
views:22
posted:10/27/2012
language:Basque
pages:17