The Matrix by TGNeDnV

VIEWS: 6 PAGES: 13

									L4F11m   145.28    0.314   Macro: ctrl-h for Windows or Opt-cmd-h for MacOS
L4F11m   138.07     0.68   Instructions:
L4F11m   114.12    0.153   a. before using this file, save it in another location, without chan
L4F11m   106.79    0.855   b. copy your raw input in the first three columns of this sheet, s
L4F11m   99.319    0.161   c. insert a row between each pattern
L4F11m   92.179    0.068   d. adjust the optional parameters (blue cells):
L4F11m   90.313    0.222   in filtro: high and low specify the MW ange you want to keep for ana
L4F11m   87.583    1.233               bands with higher or lower values ar zeroed
L4F11m   84.936    0.639   in filtro: prefilter changes to 0 values of intmm or rq lower than the s
L4F11m   80.902    0.494   in filtro: a affects the shapes of the logistic membership function; the
L4F11m   76.023    0.835               higher than 150; the curve becomes very steep at 400
L4F11m   68.184    6.139   in fuzzy: additional character allows to add characters to the strain na
L4F11m   64.338    1.122   in fuzzy: half class width controls class width
L4F11m   62.687    0.099   in fuzzy: 1.97 is the starting class in log(MW)
L4F11m    60.91    0.897   in fuzzy: filter changes to 0 the class outputs which are lower than the
L4F11m    59.59     0.88   e. make sure that the following cells are selected:
L4F11m   55.801    3.638   in Iput: A2
L4F11m    50.34   10.991   in filtro: A2
L4F11m   48.373    5.147   in fuzzy: A4
L4F11m   47.043    5.473   in Output: A2
L4F11m   45.295    1.576   f. select A2 in sheet INPUT and press ctrl-h or opt-cmd-h to star
L4F11m   41.751    4.946   g. the output accumulates in sheet Output
L4F11m   38.659   14.151   h. use Autofilter to selcet the data for further processing
L4F11m   37.641    4.532   Beware: this version includes 17 classes, width 0.04, first class 1
L4F11m   36.249    1.528   If you want to change these values and increase or decrease the num
L4F11m   34.992    0.436   it is necessary to insert or delete columns in sheet fuzzy. DO NOT si
L4F11m   34.316    0.118   or macros will not operate properly and formulas will return the wrong
L4F11m   33.498    0.856
L4F11m   32.943    1.034
L4F11m   30.614   12.244
L4F11m   26.845    1.704
L4F11m   25.654    2.687
L4F11m   23.771     0.13
L4F11m    23.61    0.398
L4F11m   23.321    2.216
L4F11m   23.007    4.821
L4F11m   22.628    1.687
L4F11m   20.579    0.239
L4F11m    20.29    1.388
L4F11m   20.079    1.057
L4F11m   17.924    2.213
 or Opt-cmd-h for MacOS

ave it in another location, without changing the filename
 the first three columns of this sheet, starting from cell A1: A strain name, B MW, C int*mm or rq

ameters (blue cells):
 fy the MW ange you want to keep for analysis;
 or lower values ar zeroed
o 0 values of intmm or rq lower than the specified fraction
es of the logistic membership function; the value must be
he curve becomes very steep at 400
er allows to add characters to the strain name

 class in log(MW)
the class outputs which are lower than the specified filter
wing cells are selected:




T and press ctrl-h or opt-cmd-h to start the macros

 the data for further processing
udes 17 classes, width 0.04, first class 1.97, a=200
  values and increase or decrease the number of classes
delete columns in sheet fuzzy. DO NOT simply delete cells
 roperly and formulas will return the wrong result
MW, C int*mm or rq
Strain   MW   value   Filtered value Strain   MW       value%
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
                                   0               0         0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
    0   0   0
0   0
Mw range:                        high >>      140
changes to 0 values outside       low >>      19.8
this range


prefilter           %>>
changes to 0 the intmm values lower of the specified filter

additional character
adds this character to the end of the strain name
                                        93         85      78       71     65         59      54
half class width    0.02         a     200 class width            0.04           number of classes
Strain           MW      value        1.97       1.93     1.89    1.85    1.81      1.77    1.73
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                     0.000     0.000     0.000   0.000   0.000     0.000 0.000
                                    0.000   0.000             0.000   0.000 0.000 0.000 0.000
                                    0.000   0.000             0.000   0.000 0.000 0.000 0.000
                                    0.000   0.000             0.000   0.000 0.000 0.000 0.000
                                    0.000   0.000             0.000   0.000 0.000 0.000 0.000
                                    0.000   0.000             0.000   0.000 0.000 0.000 0.000
                                    0.000   0.000             0.000   0.000 0.000 0.000 0.000
            0 OUT           0.000   0.000   0.000             0.000   0.000 0.000 0.000 0.000
            0 OUTfiltr          0 #DIV/0! #DIV/0!          #DIV/0!  #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0!
            0 OUTfiltr%         0 #DIV/0! #DIV/0!          #DIV/0!  #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0!

filter                     0.0001

OUT          is the sum of outputs for each class
OUTfiltr     is equal to OUT if OUT/total OUT>filter, otherwise is 0
OUTfiltr%    is OUTfiltr expressed as a percentage of total output
                      49       45     41      37      34      31      28      26      23      21 MW
number of classes              17
                     1.69    1.65    1.61    1.57    1.53    1.49    1.45    1.41    1.37    1.33 log(MW)
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
                    0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000   0.000
 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000                         0.000
#DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0!   #DIV/0!
#DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0! #DIV/0!   #DIV/0!
Ceppo$   OUTPUT$ TOT1         kDa93          kDa85      kDa78      kDa71      kDa65



L4F11m   OUT         100.00           0.51       1.94       1.10       4.36       3.53
L4F11m   OUTfiltr    100.00           0.51       1.94       1.10       4.36       3.53
L4F11m   OUTfiltr%   100.00           0.53       2.01       1.13       4.51       3.65
kDa59      kDa54      kDa49      kDa45      kDa41      kDa37      kDa34      kDa31      kDa28



    2.85       4.38      18.01       4.62       9.97      15.09       2.52      12.29       1.32
    2.85       4.38      18.01       4.62       9.97      15.09       2.52      12.29       1.32
    2.95       4.53      18.63       4.78      10.32      15.61       2.61      12.72       1.36
kDa26      kDa23      kDa21



    3.74       8.55       1.87    96.64
    3.74       8.55       1.87    96.64
    3.87       8.85       1.94   100.00

								
To top