Prezentacja programu PowerPoint by m1Z60682

VIEWS: 6 PAGES: 30

									CHROMOSOME
  WALKING
   BARDZO TREŚCIWY SKRÓT
    PIĘĆ WYBRANYCH METOD
SPACEROWANIA PO CHROMOSOMIE

  T- LINKER PCR


  SITE FINDING PCR


  BD GENOME WALKER PCR


  INVERSE PCR


  TAIL PCR
T-
LINKER
PCR
PRZYKŁAD – NIE MÓJ
SITE FINDER
PCR
STRUKTURA PRZYKŁADOWEGO SITE FINDERA
                   SITE FINDING PCR

   UNKNOWN SEQUENCE   KNOWN SEQUENCE


                      GSP 3   GSP 2   GSP 1



         GCGC
NNNNNNNNNCGCGNNNNNNN KNOWN SEQUENCE


                      GSP 3   GSP 2   GSP 1
CZY SITE FINDER JEST WAŻNY ?
BD Genome
Walker TM
STRUKTURA ADAPTORA
KONSTRUKCJA BIBLIOTEKI
                 TEMPERATURA [ oC ]   CZAS [ s ]




                         98              120
 Denaturacja
   wstępna
                         98              30
 Denaturacja
  właściwa
                         72              180
Annealing/poli
                                                   7X
  meryzacja
                         98              30
 Denaturacja

                         67              180
 Annealing/
                                                   32X
Amplifikacja

 Wydłużanie              67              300

  końcowe
                         4                ∞
   Pauza
...ACATGGTCGATGCCTTATGGTCCTGAAAA...
CO ZROBIĆ Z OTRZYMANĄ
     SEKWENCJĄ ?



  BLAST    ALIGNMENT




      ANALIZY
   LABORATORYJNE
I-PCR ( INVERSE PCR)
    HI – TAIL PCR
( High-efficiency thermal asymmetric interlaced )
PODSUMOWANIE


               SITE FINDING PCR


               Low temp. Annealing


               Site finding primer
               -
               High
               90%>
               0-4kb
               low

								
To top