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Biochemistry review

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2/21/2012
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30
BIOCHIMICA

DELLA CELLULA

DI COS’È FATTA UNA

CELLULA



• H2O costituisce il 70% del

peso di una cellula

• C, H, N, O, P, S

costituiscono il 99% della

massa di una cellula

– Altri costituenti sono Ca,

Mg, Si, K

Carbonio



• Piccole dimensioni, base della vita

• Possiede 4 elettroni

– Può formare 4 legami forti, covalenti,

con altri atomi

• Può creare molecole grandi e

complesse, senza limite di dimensioni

• H, N & O sono anch’essi atomi piccoli

in grado di formare legami covalenti

Gruppi chimici più diffusi



• Metile -CH3

• Idrossile -OH

• Carbossile -COOH

• Amino -NH2



Questi gruppi si ritrovano

in tutte le molecole

biologiche

• Una molecola si definisce organica se

contiene un atomo di C

– Le molecole organiche piccole hanno un

peso molecolare di 100-1000 dalton

• Corrisponde più o meno a 30 atomi di C



• Macromolecole sono generalmente dei

polimeri

– Ripetizioni di molecole più piccole

– Non ci sono limiti superiori alle dimensioni

• Le cellule contengono 4 famiglie

di piccole molecole organiche





– Zuccheri

– Acidi Grassi

– Aminoacidi

– Nucleotidi

Zuccheri

• Monosaccaride è l’unità base

• La formula generale è (CH2O)n

– n è un numero intero da 3 a 8

– Glucosio è C6H12O6

• Sono molecole sia ad anello sia a catena

aperta

• Contengono gruppi idrossilici e

alternativamente

– O un’aldeide

– O un chetone

• Il gruppo aldeide ed il chetone possono

– Reagire con un gruppo idrossile della stessa

molecola convertendola in un anello



• Gli anelli così formati possono unirsi in

modo da formare

– Disaccaridi

– Oligosaccaridi

– Polisaccaridi

Funzione degli Zuccheri

• Sono la principale fonte di energia per la

cellula

– Polisaccaridi semplici come Glicogeno o Amido

servono per immagazzinare energia

• Sono componenti della Matrice Extra Cellulare

(ECM)

• Possono essere legati a proteine e a lipidi per

dare origine a

– Glicoproteine

– Glicolipidi

Lipidi



• Gruppo eterogeneo di composti

• Essenzialmente atomi di

Carbonio ed Idrogeno

• Biologicamente importanti sono

– Grassi

– Fosfolipidi

– Steroidi

Lipidi

• Due regioni distinte

– Coda Idrofobica

• Lunga catena Idrocarburica

• La lunghezza e la posizione dei legami C=C

determina il tipo di lipide

– Testa Idrofilica

• Solubile in acqua, formata dai gruppi funzionali









Testa Coda

Funzione dei Lipidi

• Fonte di energia

– Producono il doppio dell’energia

rispetto agli zuccheri

• Immagazzinati nel citoplasma

sotto forma di gocce lipidiche

– Trigliceridi sono i più abbondanti negli

organismi viventi

• Glicerolo + 3 Acidi Grassi

Acidi Grassi

• Acidi Grassi Insaturi

– Atomi di C legati tra loro C=C, non

completamente saturati da H

– Mono- e Poli-insaturi

– Liquidi a temperatura ambiente

– Grassi “buoni”

• Acido Linoleico e Arachidonico, assunti dalla dieta



• Acidi Grassi Saturi

– Maggior numero possibile di atomi H

– Grassi animali e vegetali solidi a temperatura

ambiente

Aminoacidi

• Gruppo Carbossilico e Gruppo Amminico

legati allo stesso atomo di carbonio

• Sono le unità fondamentali delle Proteine

– Lunghi polimeri lineari di aminoacidi, legati

testa-coda dal Legame Peptidico tra il gruppo

carbossilico di uno ed il gruppo amminico di un

altro



• Gli aminoacidi sono 20, ognuno con una

catena laterale differente

• Vengono raggruppati in base alla

carica delle loro catene laterali:

– 2 sono acidi

– 3 sono basici

– 5 sono polari neutri

– 10 sono non polari

• Tutti hanno struttura comune:



H Carbonio



H2N-C-COOH Gruppo Carbossilico

Gruppo Amminico



R Catena Laterale

Nucleotidi

• Composti ad anello contenenti

Azoto legati ad uno zucchero a 5

atomi di carbonio ed un gruppo

fosfato

– Gli anelli vengono chiamati Base

perché possono legare H+

– Lo zucchero a 5 carbonii è un

Ribosio o un Deossiribosio

Pirimidine









Purine

Funzioni dei Nucleotidi

• ATP (Adenosina Trifosfato)

– Rilascia energia quando convertita ad ADP



• AMP Ciclico

– Molecola segnale all’interno della cellula



• Possono combinarsi con altri elementi e

formare i coenzimi (Coenzima A)

• Trasmettono l’informazione genetica

– Sono i costituenti degli Acidi Nucleici

Dalle Molecole piccole alle

Macromolecole

• Macromolecole

– Peso molecolare da 10,000 a 1 milione di Dalton

• Normalmente ripetizioni di zuccheri,

amminoacidi, nucleotidi e acidi grassi

• La formazione di macromolecole prevede la

formazione di legami covalenti, la cui forza è

tale da preservare la sequenza di sub-unità

per un lungo periodo di tempo

Macromolecole

• Dimensioni e complessità intermedie tra

le molecole piccole e gli organelli cellulari

• Polimeri di sub-unità, che possono

combinarsi tra loro

– Nucleoproteine = nucleotidi + proteine

– Proteoglicani = carboidrati + catene laterali

delle proteine

– Glicoproteine = proteine + carboidrati

– Glicolipidi = lipidi + carboidrati

Macromolecole





• Acidi Nucleici

• Proteine

• Lipidi

• Carboidrati

Acidi Nucleici

• Polimeri lunghi

– Nucleotidi legati

covalentemente da

Legame

Fosfosdiesterico

• 3’ OH dello

zucchero

• 5’ fosfato del

nucleotide

successivo

• RNA - Acido Ribonucleico

– L’impalcatura è basata sul ribosio

– Adenina, Uracile, Guanina, Citosina

– Nucleolo, Ribosomi

• DNA - Acido Deossiribonucleico

– L’impalcatura è basata sul deossiribosio

– Adenina, Timina, Guanina, Citosina

– Nucleo, Mitocondri

• Appaiamenti

– A con T (o U) e G con C

Adenosina Trifosfato (ATP)

• L’energia chimica derivante dal glucosio

viene trasferita all’ATP

– Legami specializzati, detti legami fosfato ad

alta energia

• Questo tipo di energia può essere usata

subito dalla cellula per il proprio lavoro

– Sintesi delle proteine

– Trasporto attivo attraverso la membrana

– Contrazione (muscolo)

Proteine



• 50% della materia organica del

corpo umano

• Eseguono praticamente tutte le

funzioni cellulari

– Proteine strutturali

– Proteine funzionali

Proteine Strutturali

• Proteine Fibrose

– Struttura semplice allungata

– Possono essere molto lunghe

– Filamenti intermedi, cheratine

• Interne alla cellula

– Collagene

• Esterno alla cellula

• Tutte le proteine extracellulari

sono stabilizzate da Ponti

Disolfuro

– Legami covalenti S-S

Proteine Funzionali

• Proteine Globulari

– La catena polipeptidica si ripiega a formare una

struttura compatta di forma sferica irregolare

• Proteine Mobili

• Fanno tutto il lavoro nella cellula

– Anticorpi

– Ormoni

– Trasporto Cellulare

– Catalizzatori ed enzimi

• Praticamente tutto il lavoro che avviene nel corpo

Lipidi

• Grassi Neutri

– Maggior fonte di energia

• Fosfolipidi

– Membrane cellulari

• Steroidi, basati sul colesterolo

– La maggior parte degli ormoni

• Altre sostanze lipidiche

– Vitamine solubili nei grassi

– Prostaglandine

Carboidrati

• Grandi molecole insolubili

• 1-2% della massa cellulare

• Metabolizzati a glucosio, quindi a biossido

di carbonio (CO2), acqua e ATP

– Metabolizzati a livello mitocondriale

(respirazione)

• Amido

– Tessuti vegetali

• Glicogeno

– Tessuti animali

Oltre l’energia…

• Zuccheri ed acqua

rendono le cose

“scivolose”

– Muco

• Azione protettiva in

condizioni difficili

– Glicocalice e Muco

• Agiscono da siti di

riconoscimento sulle

membrane

– Riconoscimento cellulare,

virus, ormoni, batteri



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