SUJETS DE THESE
Proposition pour la rentrée universitaire 2011 – 2012
Etablissement Sujet Laboratoire Encadrants Courriel
Angers Physiopathologie de l’intolérance à la UMR 6214-INSERM771 Pierre ABRAHAM pierre.abraham@univ-angers.fr
marche au cours des claudications d’allure Fallou CISSE
vasculaire
(en savoir plus…)
Angers Rôle du tissu médullosurrénalien dans les UMR 6214-INSERM771 Nathalie GUERINEAU nathalie.guerineau@univ-angers.fr
processus infectieux : implication des
chromogranines
Study of the role of the adrenal medulla
during infection : involvement of
chromogranins
(en savoir plus...)
Angers Distorsions des hélices-alpha : application à UMR 6214 – INSERM771 Marie CHABBERT marie.chabbert@niv-angers.fr
la modélisation des protéines membranaires
Distortions of alpha-helices and molecular
modeling of transmembrane proteins
(en savoir plus...)
Angers Programmation des maladies UMR 6214 – INSERM771 Céline FASSOT-LUCHT celine.fassot@inserm.fr
cardiovasculaires : influence des facteurs de
risques environnementaux durant la
grossesse
(en savoir plus…)
Angers Nanocapsules à cœur aqueux pour la vec UMR 646 Patrick SAULNIER patrick.saulnier@univ-angers.fr
torisation d’actifs pharmaceutiques
hydrophiles fragiles
Aqueous core nanocapsules for the delivery
of fragile hydrophilic drugs
(en savoir plus...)
Nantes Cellules Th17 dans l’asthme UMR 915 MAGNAN Antoine antoine.magnan@univ-nantes.fr
Th17 cells in asthma
(en savoir plus...)
Nantes Régulation du gène HEF1 impliqué ans EA 1155 Christos ROUSSAKIS christos.roussakis@univ-nantes.fr
l’apoptose par le nouvel ARN non codant B2
dans le CBPNC
(en savoir plus…)
Nantes Vers l’utilisation de “C-type lectin receptors” UMR 892 Jacques LE PENDU jacques.le-pendu@inserm.fr
(CLR) en immunothérapie du cancer Frédéric ALTARE
(en savoir plus…)
Nantes Formes mutées de JAK2 : structure, UMR 892 Sylvie HERMOUET sylvie.hermouet@univ-nantes.fr
interactions protéine-protéine, fonction,
conséquences pour a cellule et pour l’hémat
(en savoir plus…)
Nantes Evaluation de la combinaison de drogues UMR 892 Marc GREGOIRE marc.gregoire@nantes.inserm.fr
épigénétiques pour le traitement du Christophe BLANQUART
mésothéliome pleural malin.
Evaluation of epigenetic drugs combinations
to treat malignant pleural mesothelioma
(en savoir plus...)
Nantes Médecine régénérative du disque UMR 791 Jérôme GUICHEUX jerome.guicheux@inserm.fr
intervertébral : transplantation de cellules Johann CLOUET
souches par un biomatériau
Regenerative medicine of intervertebral
disc : transplantation of stem cells with
biomaterials
(en savoir plus...)
Nantes Caractérisation du rôle de PiT1 dans les UMR 791 Jérôme GUICHEUX jerome.guicheux@univ-nantes.fr
tissus squelettiques : étude des fonctions
indépendantes du transport de phosp
Deciphering the roles of PiT1 in skeletal
tissues : insights in its new Pi-transport
independent functins, and roles of its protein
partners
(en savoir plus…)
Nantes Etude de la différentiation de cellules UMR 957 Pierre LAYROLLE pierre.layrolle@inserm.fr
souches dans l’environnement
tridimensionnel de l’ostéosarcome
Stuy of the differentiation of stem cells in
tridimensional model of osteosarcoma
(en savoir plus...)
Nantes Modèle épidémiologique spatio-temporel en UMR 1300 - BIOEPAR Pauline EZZANO pauline.ezzano@oniris-nantes.fr
métapopulation : application au virus de la Elisabeta VERGU
diarrhée virale bovine
Spatio-temporal epidemiological model in
metapopulation : application to the bovine
viral diarrhea virus
(en savoir plus...)
Nantes Norovirus et coquillages : approche de IFREMER E17 Soizick LE GUYADER sleguyad@ifremer.fr
l’évaluation de la persistance et du pouvoir Jacques LE PENDU
infectieux
Norovirus and shellfish : a study on viral
persistence and infectivity evaluation
(en savoir plus...)
Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Physiopathologie de l'intolérance à la marche au cours des
claudications d'allure vasculaire
1. . Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : ABRAHAM Pierre
% d'encadrement (minimum 40%) : 50
Mail du directeur de thèse : pierre.abraham@univ-angers.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0665807451
Fax du directeur de thèse : 0241353693
Le cas échéant
Nom et prénom du co-directeur (obligatoirement HDR) : CISSE Fallou
Mail du co-directeur : falloucisse@yahoo.fr
Téléphone du co-directeur : +221 33 865 23 56
Fax du co-directeur : +221 33 860 35 16
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : UMR CNRS6214-INSERM771
Nom et prénom du responsable du laboratoire : HENRION Daniel
Nom et prénom du responsable de l'équipe : LEFTHERIOTIS Georges
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : OUEDRAOGO Nafi
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Physiopathologie humaine et modèles experimentaux (Angers)
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : A la marche et lors d'efforts sous maximaux,
physiologiquement la pression artérielle en oxygène augmente avec diminution après l'effort. Le travail de Master 2 de Mme Ouedraogo a
permis de développer en collaboration avec l'Ecole supérieure d'électronique de l'Ouest (ESEO) une approche d'analyse automatisée des
profils observés par mesure de la pression partielle transcutanée en oxygène (tcpO2 ) chez des patients présentant des intolérances d'effort. Ce
travail montre que environ 15 % des patients présentant une gêne fonctionnelle à la marche, ont un profil de mesure de tcpO2 thoracique
différent du profil attendu sur le plan physiologique, mais caractéristique. Ce profil spécifique est caractérisé par une chute rapide dès le
début de la marche, une remontée progressive pendant la marche et un « overshoot » à l'arrêt de la marche (profil ON/OFF). Un travail en
cours confirme par mesures répétées des gaz du sang artériel, le caractère pathologique des observations faites en tcpo2. Cette étude apportera
ainsi la preuve d'un nouveau concept physiopathologique des intolérances d'effort. Dans les trois années de la thèse, le but sera d'étudier la
physiopathologie de ces patients, l'évolution de leur maladie et les effets de traitements qui pourraient leurs être proposés et permettra: 1/
d'évaluer la prévalence des désordres ventilatoires du sommeil (DVS) chez les patients qui nous sont adressés pour claudication d'effort
d'allure vasculaire. 2/ d'évaluer l'effet de la prise en charge de ces désordres ventilatoires du sommeil sur la performance à la marche. 3/ de
confirmer que la présence d'un profil ON/OFF en tcpo2 est prédictive de la présence d'un désordre ventilatoire nocturne.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Régulation du gène HEF1 impliqué dans l'apoptose par le
nouvel ARN non codant B2 dans le CBPNC.
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Pr.Christos.roussakis
% d'encadrement (minimum 40%) : 100%
Mail du directeur de thèse : Christos.Roussakis@univ-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0643115298
Fax du directeur de thèse : 0251125690
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : EA-1155 IIciMED E.R.T-A 0902Cancer du Poumon et Cibles Moléculaires
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Pr. Patrice LE PAPE
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Pr.Christos ROUSSAKIS
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : Melle ROUSSEAU Bénédicte
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Biologie, Biotechnologie, Recherches Thérapeutiques .Université de Nantes
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Afin de développer de nouveaux traitements plus efficaces pour les
cancers broncho-pulmonaires « non à petites cellules » (CBNPC) nous utilisons des molécules cytostatiques et antimorales pour atteindre deux
nouvelles cibles moléculaires, les gènes B2 et HEF1. Le projet que nous présentons consiste à démontrer que lorsque le gène HEF1 est
surexprimé, l'ARN B2 génère des miRNA dirigés contre le messager HEF1 provoquant sa disparition dans les cellules tumorales et le
déclenchement de l'apoptose.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Cellules Th17 dans l'asthme
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Th17 cells in asthma
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Magnan Antoine
% d'encadrement (minimum 40%) : 40 %
Mail du directeur de thèse : antoine.magnan@univ-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0634532120
Fax du directeur de thèse : 02 40 16 5
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : UMR 915, équipe AVENIR "Pathologies bronchiques et allergies"
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Pacaud Pierre
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Magnan Antoine
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : Chesné Julie
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : BBRT Nantes
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) :
Analyse du rôle des lymphocytes Th17 dans l’asthme
Introduction
L’inflammation dans l’asthme est dominée par une réponse Th2 conduisant à l’infiltration des voies aériennes par des polynucléaires
éosinophiles. Cependant une élévation des polynucléaires neutrophiles (PNN) est retrouvée chez l’asthmatique. Plusieurs travaux suggèrent que
les lymphocytes Th17 puissent être responsables de l’afflux de PNN. Ainsi l’IL-17 a été impliquée dans les mécanismes de l’hyperréactivité des
voies aériennes. Cependant ce rôle des Th17 dans l’asthme n’a pas été mis en relation ni avec l’activation Th2, ni avec l’importance de
l’activation des PNN.
Matériel et méthodes
Un modèle original d’asthme allergique induit par les acariens (Der f) est disponible au laboratoire. L’activation des lymphocytes T Th17 (IL-
17, IL-23, IL-25), Th2 (IL-4, IL-5, IL-13) Th1 (IFN-) et régulateurs (IL-10, TGF-beta, expression de CD25 (high), C127 (low) et FoxP3) sera
analysée à J1 et J3 après chaque challenge intra-nasal par l’extrait d’acariens chez les animaux sensibilisés par voie trans-cutanée par cytométrie
de flux, après stimulation non spécifique et spécifique (extrait de Der f et protéine Der f 1 purifiée). Le modèle d’allergie aux acariens sera induit
chez des souris KO pour le gène de l’IL-17 et les analyses ci-dessus seront renouvelées dans ce modèle. Le transfert passif de cellules de souris
sauvages sensibilisées permettra de rétablir le phénotype asthmatique. Dans le cadre d’une collaboration avec B Malissen (CIML, Marseille), les
expériences seront également renouvelées chez des souris dépourvues de PNN.
Résultats attendus et perspectives.
Ce travail permettra de préciser l’importance de l’activation Th17 dans l’asthme. L’utilisation d’inhibiteurs spécifiques permettra par la suite de
développer une stratégie thérapeutique pré-clinique.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Rôle du tissu médullosurrénalien dans les processus
infectieux : implication des chromogranines
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Study of the role of the adrenal medulla during infection: involvement of chromogranins
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : GUERINEAU Nathalie
% d'encadrement (minimum 40%) : 100
Mail du directeur de thèse : nathalie.guerineau@univ-angers.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0241735833
Fax du directeur de thèse : 0241735895
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : Laboratoire de Biologie Neurovasculaire Intégrée, CNRS UMR6214 ; INSERM U771
Thème "Neurosécrétion, Stress et Fonction Vasculaire"
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Dr. HENRION Daniel
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Dr. GUERINEAU Nathalie
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
:
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Nous proposons un projet transversal reposant sur la
communication entre les systèmes neuroendocrine et immunitaire. Il a pour objectif de caractériser le rôle des chromogranines libérées par le
tissu médullosurrénalien, dans les processus infectieux. Ce projet s'inscrit dans une recherche à enjeu important en Santé Publique, le sepsis étant
une cause majeure de mortalité. Les états infectieux sévères se caractérisent par une hypotension artérielle persistente associée à une chute du
tonus vasculaire périphérique. La thérapie clinique consiste à administrer des catécholamines, libérées naturellement par les cellules chromaffines
des glandes médullosurrénales. L'infection, perçue comme un stress, active le système sympatho-médullosurrénalien. De manière intéressante,
les cellules chromaffines sécrètent également des peptides dérivés des chromogranines, impliqués dans l'immunité innée. Ainsi, le taux de
chromogranines circulantes est augmenté chez les patients septiques tandis que l'expression de certains peptides est diminuée. Ce projet intègre
des études cellulaires et moléculaires. Nous caractériserons i) le remodelage du couplage stimulation-sécrétion des cellules chromaffines, en
étudiant les changements de leurs propriétés électriques et des voies de signalisation intercellulaire impliquées dans la sécrétion des
catécholamines et chromogranines (approche sur tranches de tissu surrénalien de rat) et ii) les effets des chromogranines et peptides dérivés sur la
réactivité vasculaire (artères mésentériques). Au niveau moléculaire, nous déterminerons dans quelle mesure l'infection altère les modifications
post-traductionnelles des chromogranines et l'expression des peptides dérivés au niveau du tissu surrénalien (étude en collaboration). La
réalisation de ce projet permettra de comprendre comment les états infectieux altèrent le tissu médullosurrénalien responsable de la sécrétion des
catécholamines et modifient l'expression des chromogranines pour combattre le sepsi
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : We propose a
project based on cross-communication between the neuroendocrine and immune systems. It aims to elucidate the role of chromogranins released
by the adrenal medulla during infection process. This is an important issue in public health, sepsis being a major cause of mortality. Many
arguments suggest a crucial contribution of the adrenomedullary tissue in severe infections. These are characterized by persistent arterial
hypotension associated with a fall in peripheral vascular tone. Standard clinical therapy consists in administering catecholamines, which are
released naturally by adrenal chromaffin cells. Infection is perceived by the body as a stressor and therefore activates the sympatho-adrenal
medullary system. In addition to catecholamines, chromaffin cells secrete biologically active peptides derived from chromogranins. Some of
them are involved in innate immunity. Interestingly, the amount of circulating chromogranins is increased in septic patients while the expression
of some peptides is reduced. This project combines cellular and molecular studies. We will first study the remodeling of the stimulus-secretion
coupling of chromaffin cells by characterizing the changes in electrical properties of chromaffin cells and the intercellular signaling pathways
involved in the secretion of catecholamines and chromogranins (synaptic transmission and gap junctional coupling) in acute adrenal slices.
Second, we will investigate the effects of peptides derived from chromogranins on arterial vascular reactivity (mesenteric arteries). At the
molecular level, we will determine how the infection process affects the post-translational modifications and expression of chromogranin-derived
peptides present in the medullary tissue (collaborative study). Completion of this project will better understand how sepsis modifies the adrenal
medullary tissue responsible for the secretion of catecholamines and alters the expression of chromogranins to fight again sepsis.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Vers l'utilisation de « C-type lectin receptors » (CLR) en
immunothérapie du cancer
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Le Pendu Jacques
% d'encadrement (minimum 40%) : 50%
Mail du directeur de thèse : jacques.le-pendu@inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0228080317
Fax du directeur de thèse : 0228080204
Le cas échéant
Nom et prénom du co-directeur (obligatoirement HDR) : Altare Frédéric
Mail du co-directeur : frederic.altare@inserm.fr
Téléphone du co-directeur : 0228080207
Fax du co-directeur : 0228080204
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : CRCNA, INSERM U892, équipe 5
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Bonneville Marc
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Le Pendu Jacques/Altare Frédéric
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : Mevel Elsa
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Pharmacologie, Université de Strasbourg
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Les CLRs sont des lectines endogènes capables de reconnaître un
large spectre de motifs caractéristiques d'agents pathogènes mais également présents sur certaines cellules saines et fréquemment surexprimés sur
les cellules tumorales. Le projet vise à remplacer le récepteur T de lymphocytes cytotoxiques par un CLR aussi spécifique que possible de motifs
osidiques caractéristiques des cellules cancéreuses de façon a obtenir une lyse de cellules tumorale indépendante de la présentation antigénique
par le complexe majeur d'histocompatibilité. La Prolectine est un CLR humain récemment décrit dont la capacité de reconnaissance
d'oligosaccharides synthétiques suggère une probable capacité de reconnaissance de nombreux types de cellules cancéreuses. Nous vérifierons
cette spécificité de la Prolectine recombinante sur un panel de lignées tumorales ainsi que sur des coupes de tissus sains et pathologiques. Son
domaine lectine sera ensuite fusionné à la chaine CD3ζ et exprimé sur des lymphocytes T cytotoxiques par l'intermédiaire d'un vecteur
rétroviral. On vérifiera que ces lymphocytes exprimant le récepteur chimérique seront capables de lyser diverses cellules tumorales exprimant des
ligands de la Prolectine.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Médecine régénérative du disque intervertébral:
transplantation de cellules souches par un biomatériau
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Regenerative medicine of intervertebral disc: transplantation of stem cells with
biomaterials
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : GUICHEUX Jérôme
% d'encadrement (minimum 40%) : 50
Mail du directeur de thèse : jerome.guicheux@inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0240412916
Fax du directeur de thèse : 0240083712
% d'encadrement : 50
OU
Nom et prénom du co-encadrant : CLOUET Johann
% d'encadrement : 50
Mail du co-encadrant : johann.clouet@univ-nantes.fr
Téléphone du co-encadrant : 0642277356
Fax du co-encadrant : 0240083712
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : INSERM U791 Groupe STEP Skeletal Tissue Engineering and Physiopathology
Nom et prénom du responsable du laboratoire : WEISS Pierre
Nom et prénom du responsable de l'équipe : GUICHEUX Jérôme
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : COLOMBIER Pauline
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Master II Biothérapies tissulaire, cellulaire et génique, Paris XIII
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Le disque intervertébral (DIV) est l'objet d'une dégénérescence
tissulaire liée à l'âge. Elle s'accompagne d'une perte progressive de son rôle dans la cinématique rachidienne et entraîne des douleurs lombaires
qui affectent une part importante de la population. Dans ce contexte, la régénération du DIV par ingénierie tissulaire est aujourd'hui considérée
comme une approche prometteuse. Ce concept a pour principe la transplantation de cellules autologues à l'aide de biomatériaux. Notre
laboratoire a ainsi breveté un biomatériau injectable. Celui-ci a bénéficié d'avancées majeures dans le domaine de la thérapie cellulaire du
cartilage articulaire ces dernières années. Les similitudes, en particulier structurelle et phénotypique observées entre le cartilage articulaire et le
DIV permettent aujourd'hui d'envisager la transposition des résultats obtenus en ingénierie tissulaire du cartilage articulaire au DIV. Après avoir
développé et validé deux modèles animaux complémentaires de dégénérescence discale chez le lapin (spontané et induit par traitement laser)
nous souhaitons tester l'efficacité thérapeutique de l'injection de cellules souches mésenchymateuses (CSM) autologues par notre biomatériau.
Leur phénotype sera évalué avant et après mélange avec notre hydrogel par des analyses transcriptomiques et protéomiques. En parallèle nous
souhaitons mettre en place les premiers tests d'injection du substitut biomatériau/CSM en site discal. Une analyse précise du devenir in situ du
couple biomatériau-cellules sera réalisée à l'aide de différents outils : histologie, IRM, radiographies, microscanner, caméra ultra-sensibles.
Enfin, la régénération discale induite par l'injection du couple biomatériau-cellules sera testée dans les deux modèles animaux et suivie par
histologie, IRM et analyse phénotypique. L'ensemble de ces expériences pourrait permettre d'ouvrir de nouvelles fenêtres thérapeutiques dans le
traitement de la dégénérescence discale à l'origine de la lombalgie.
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : The intervertebral
disc (IVD) is affected by a process of age-dependent tissue degeneration. It is accompanied by a progressive loss of its role in spine kinematics
that ultimately induce low back pain affecting a large proportion of the population. In the light of this clinical challenge, the regeneration of IVD
by tissue engineering is now considered a promising approach. This concept is based on the transplantation of autologous reparative cells with
biomaterials. In this context, our laboratory has recently patented an injectable biomaterial (hydrogel). Past few years, this biomaterial has been
shown to be a promising carrier for the transplantation of autologous mesenchymal stem cells (MSC) in the field of articular cartilage
regeneration. The structural and phenotypic similarities observed between articular cartilage and IVD lead us to consider with interest the
transposition of our results obtained in articular cartilage repair to the IVD. Having developed and characterized two complementary animal
models of disc degeneration in rabbits (spontaneous and induced by laser treatment), we are now interested in testing the therapeutic efficacy of
the transplantation of autologous MSC by our biomaterial. First, the phenotype of MSC will be evaluated before and after mixing with our
biomaterial by transcriptomic and proteomic analysis. In parallel, we will test the feasibility of injecting our hybrid construct biomaterial/MSC in
IVD. A detailed analysis of the in situ behavior of hybrid constructs will be performed using different analytical approaches: histology, MRI,
radiology, micro computed-tomography (µscan) and ultra-sensitive camera. Finally, disc regeneration induced by the transplantation of
biomaterial/MSC constructs will be evaluated in both animal models by histology, MRI, radiology and phenotypic analysis. All of these
experiences could help open new windows in the therapeutic treatment of disc degeneration at the origin of low back pain.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Caractérisation du rôle de PiT1 dans les tissus squelettiques
: étude des fonctions indépendantes du transport de phosp
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Deciphering the roles of PiT1 in skeletal tissues: insights in its new Pi-transport
independent functions, and roles of its protein partners
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Guicheux Jérôme
% d'encadrement (minimum 40%) : 20
Mail du directeur de thèse : jerome.guicheux@inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0240412919
% d'encadrement : 80
OU
Nom et prénom du co-encadrant : Beck Laurent
% d'encadrement : 80
Mail du co-encadrant : laurent.beck@inserm.fr
Téléphone du co-encadrant : 0240412920
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : INSERM U791-Groupe STEP
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Weiss Pierre
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Guicheux Jérôme
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
:
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : PiT1 est un transporteur de phosphate (Pi), anion essentiel à la
minéralisation du squelette. Nos résultats récents, obtenus par invalidation de PiT1 in vitro (siRNA) ou in vivo (souris knockout), montrent que
PiT1 est une proteine multifonctionnelle modulant la prolifération cellulaire et l'apoptose. Ces fonctions impliquent les voies de signalisation
p38, JNK et NFkB, et sont indépendantes des fonctions de transport de Pi de PiT1. De multiples arguments plaident en faveur d'un rôle
fonctionnel de la large boucle intracellulaire de PiT1 (iLoop1) dans ces fonctions. En utilisant iLoop1 comme appât dans un crible double-
hybride, nous avons identifié une vingtaine de partenaires potentiels impliqués, entre autres, dans les voies NFkB, l'import nucléaire ou l'apotose.
Ainsi, la protéine multi-fonctionnelle FHL2, dont l'invalidation induit une ostéopénie en dérégulant les voies RANK/NFkB, est partenaire de
PiT1. De même, TRAF2, lui-même partenaire de FHL2, est partenaire de PiT1. Notre hypothèse est que PiT1 constituerait une protéine
d'échafaudage essentielle pour la formation des complexes impliqués dans les voies RANK/NFkB. Ce projet implique d'étudier l'interaction de
PiT1 et de certains de ses partenaires par résonance de surface (BIAcore) ou FRET et d'analyser leurs interactions dans un contexte
physiologique en utilisant les modèles de souris disponibles (KO PiT1, FHL2, TRAF2). Nous compléterons cette approche en étudiant l'inter-
relation de PiT1 et FHL2 sur la prolifération et la différentiation d'ostéoblastes in vitro inactivés pour PiT1 et/ou FHL2. D'autre part, puisque
nous avons montré que iLoop1 localise dans le noyau, ce projet implique l'étude de la localisation nucléaire de iLoop1 par une approche FRAP.
�
La pertinence fonctionnelle de la localisation nucléaire de iLoop1 sera étudiée en utilisant entre autres des mutants boucle â� NLS et une
invalidation de l'importine alpha7, essentielle au transport actif nucléaire, et partenaire de iLoop1.
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : PiT1 is a phosphate
(Pi) transporter present in bon and many other tissues. Our recent results obtained by inactivating PiT1 in vitro (siRNA) or in vivo (knockout
mice) show that PiT1 is a multifunctional protein that modulates cell proliferation and apoptosis. These functions involve the signaling pathways
p38, JNK and NFkB, and are independent of the Pi transport function of PiT1. Multiple arguments have been raised suggesting that the large
intracellular loop of PiT1 (iLoop1) could mediate these functions. We used iLoop1 as a bait in a two-hybrid screen, and identified twenty
potential partners involved, among others, in the NFkB pathways, nuclear import or apoptosis. Among them are the multifunctional protein
FHL2, which invalidation leads to osteopenia induced by misregulation of the RANK/NF-κB pathway, the ubiquitin ligase TRAF2 involved in
the NF-κB pathway and partner of FHL2, and importin α7 allowing active nuclear transport. Our hypothesis is that PiT1 could be a scaffolding
protein essential to the formation of protein complexes involved in the RANK/NFkB pathway. This project involves studying the interaction of
PiT1 and some of its partners by surface resonance (BIAcore) or FRET and analyze their interactions in a physiological context by using
available mouse models available (PiT1, FHL2, TRAF2 mice KO). We will complete this approach by studying the interrelationship of PiT1 and
FHL2 on the proliferation and differentiation of osteoblasts inactivated for PiT1 and/or FHL2. On the other hand, since we have shown that
iLoop1 locates in the nucleus, this project involves the study of the nuclear localization iLoop1 using a FRAP approach. The functional relevance
of the nuclear localization of iLoop1 will be studied using � NLS loop mutants and an invalidation of importin α7, essential for active nuclear
transport, and partner of iLoop1.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Etude de la différentiation de cellules souches dans
l'environnement tridimensionnel de l'ostéosarcome
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Study of the differentiation of stem cells in tri dimensional model of osteosarcoma
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : LAYROLLE Pierre
% d'encadrement (minimum 40%) : 100%
Mail du directeur de thèse : pierre.layrolle@inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0272641143
Fax du directeur de thèse : 0240412860
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : UMR 957, Laboratoire de physiopathologie de la résorption osseuse
Nom et prénom du responsable du laboratoire : HEYMANN Dominique
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : GAMBLIN Anne-Laure
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Physiologie, biomolécules et thérapeutique, Université Francois Rabelais, Tours
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Notre objectif est de développer ex vivo une unité
tridimensionnelle (3D) de tissu osseux à partir de cellules souches mésenchymateuses, d'ostéoclastes, d'une matrice extracellulaire synthétique et
de molécules régulatrices. En recherche fondamentale, ces systèmes pourront être utilisés pour « décortiquer » les mécanismes de formation et de
résorption osseuse mais aussi pour étudier les pathologies osseuses telles que l'ostéoporose ou les tumeurs osseuses.
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : Our aim is to grow
ex vivo a 3 dimensional unit of bone tissue strating from human mesenchymal stem cells, osteoclasts, synthetic extracellular matrices and
cytokines. In fundamental research, these models may be used for understanding bone formation and remodeling or the interaction with
osteosarcoma cells.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Caractérisation du rôle de PiT1 dans les tissus squelettiques
: étude des fonctions indépendantes du transport de phosp
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Deciphering the roles of PiT1 in skeletal tissues: insights in its new Pi-transport
independent functions, and roles of its protein partners
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Guicheux Jérôme
% d'encadrement (minimum 40%) : 20
Mail du directeur de thèse : jerome.guicheux@inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0240412919
% d'encadrement : 80
OU
Nom et prénom du co-encadrant : Beck Laurent
% d'encadrement : 80
Mail du co-encadrant : laurent.beck@inserm.fr
Téléphone du co-encadrant : 0240412920
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : INSERM U791-Groupe STEP
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Weiss Pierre
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Guicheux Jérôme
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
:
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : PiT1 est un transporteur de phosphate (Pi), anion essentiel à la
minéralisation du squelette. Nos résultats récents, obtenus par invalidation de PiT1 in vitro (siRNA) ou in vivo (souris knockout), montrent que
PiT1 est une proteine multifonctionnelle modulant la prolifération cellulaire et l'apoptose. Ces fonctions impliquent les voies de signalisation
p38, JNK et NFkB, et sont indépendantes des fonctions de transport de Pi de PiT1. De multiples arguments plaident en faveur d'un rôle
fonctionnel de la large boucle intracellulaire de PiT1 (iLoop1) dans ces fonctions. En utilisant iLoop1 comme appât dans un crible double-
hybride, nous avons identifié une vingtaine de partenaires potentiels impliqués, entre autres, dans les voies NFkB, l'import nucléaire ou l'apotose.
Ainsi, la protéine multi-fonctionnelle FHL2, dont l'invalidation induit une ostéopénie en dérégulant les voies RANK/NFkB, est partenaire de
PiT1. De même, TRAF2, lui-même partenaire de FHL2, est partenaire de PiT1. Notre hypothèse est que PiT1 constituerait une protéine
d'échafaudage essentielle pour la formation des complexes impliqués dans les voies RANK/NFkB. Ce projet implique d'étudier l'interaction de
PiT1 et de certains de ses partenaires par résonance de surface (BIAcore) ou FRET et d'analyser leurs interactions dans un contexte
physiologique en utilisant les modèles de souris disponibles (KO PiT1, FHL2, TRAF2). Nous compléterons cette approche en étudiant l'inter-
relation de PiT1 et FHL2 sur la prolifération et la différentiation d'ostéoblastes in vitro inactivés pour PiT1 et/ou FHL2. D'autre part, puisque
nous avons montré que iLoop1 localise dans le noyau, ce projet implique l'étude de la localisation nucléaire de iLoop1 par une approche FRAP.
�
La pertinence fonctionnelle de la localisation nucléaire de iLoop1 sera étudiée en utilisant entre autres des mutants boucle â� NLS et une
invalidation de l'importine alpha7, essentielle au transport actif nucléaire, et partenaire de iLoop1.
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : PiT1 is a phosphate
(Pi) transporter present in bon and many other tissues. Our recent results obtained by inactivating PiT1 in vitro (siRNA) or in vivo (knockout
mice) show that PiT1 is a multifunctional protein that modulates cell proliferation and apoptosis. These functions involve the signaling pathways
p38, JNK and NFkB, and are independent of the Pi transport function of PiT1. Multiple arguments have been raised suggesting that the large
intracellular loop of PiT1 (iLoop1) could mediate these functions. We used iLoop1 as a bait in a two-hybrid screen, and identified twenty
potential partners involved, among others, in the NFkB pathways, nuclear import or apoptosis. Among them are the multifunctional protein
FHL2, which invalidation leads to osteopenia induced by misregulation of the RANK/NF-κB pathway, the ubiquitin ligase TRAF2 involved in
the NF-κB pathway and partner of FHL2, and importin α7 allowing active nuclear transport. Our hypothesis is that PiT1 could be a scaffolding
protein essential to the formation of protein complexes involved in the RANK/NFkB pathway. This project involves studying the interaction of
PiT1 and some of its partners by surface resonance (BIAcore) or FRET and analyze their interactions in a physiological context by using
available mouse models available (PiT1, FHL2, TRAF2 mice KO). We will complete this approach by studying the interrelationship of PiT1 and
FHL2 on the proliferation and differentiation of osteoblasts inactivated for PiT1 and/or FHL2. On the other hand, since we have shown that
iLoop1 locates in the nucleus, this project involves the study of the nuclear localization iLoop1 using a FRAP approach. The functional relevance
of the nuclear localization of iLoop1 will be studied using � NLS loop mutants and an invalidation of importin α7, essential for active nuclear
transport, and partner of iLoop1.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Nanocapsules à cœur aqueux pour la vectorisation d'actifs
pharmaceutiques hydrophiles fragiles.
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Aqueous core nanocapsules for the delivery of fragile hydrophilic drugs
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Saulnier Patrick
% d'encadrement (minimum 40%) : 100%
Mail du directeur de thèse : patrick.saulnier@univ-angers.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0244688542
Fax du directeur de thèse : 0244688546
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : Inserm U646"Ingéniérie de la vectorisation particulaire"
Nom et prénom du responsable du laboratoire : BENOIT Jean-Pierre
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : Maria Valverde Vicente
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Faculté de Pharmacie de Seville (Espagne)
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : L'élaboration de nano-objets capables de transporter et de libérer à
façon des médicaments hydrophiles avec une efficacité avérée in vivo est un challenge important qui intéresse la communauté biomédicale et
pharmaceutique. Le laboratoire Inserm U646 a conçu (brevet Inserm Transfert) et s'attache à valoriser de nouvelles nanocapsules à cœur aqueux
qui ont montré de fortes potentialités pour la libération de petites molécules hydrophiles (Hydrochlorate de doxorubicine). Un des objectifs à
moyen terme est la vectorisation de macromolécules (protéines, oligonucléotides) sur des modèles in vitro et in vivo développés au sein du
laboratoire. Les objectifs de cette thèse de doctorat sont -l'optimisation du procédé de fabrication pour diminuer la toxicité de ces objets
nanoparticulaires. -l'amélioration des taux d'encapsulation tout en préservant l'activité biologique des actifs encapsulés. -une première évaluation
in vitro et in vivo sur des modèles pertinents. Le doctorant devra mener un travail transversal s'inscrivant dans les domaines de la pharmacie
galénique, de la physico-chimie. Des connaissances dans les domaines de la biologie cellulaire seront appréciées.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Reprogrammation et régénération cardiaque par transfert de
protéines in vivo
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Lemarchand Patricia
% d'encadrement (minimum 40%) : 100%
Mail du directeur de thèse : patricia.lemarchand@univ-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0228080133
Fax du directeur de thèse : 0228080130
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : Inserm UMR915
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Le Marec Hervé (à partir de jan 2012)
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Pitard Bruno
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : Biteau Kevin
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Master2 BBRT (Nantes)
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : La thérapie cellulaire cardiaque constitue un traitement prometteur
pour l'infarctus du myocarde (IM). Néanmoins, il est limité par sa capacité à régénérer les cardiomyocytes perdus. La technologie des cellules
pluripotentes induites (iPS) et plus récemment de reprogrammation cellulaire directe permet d'envisager une nouvelle stratégie de thérapie
régénérative. Néanmoins, elle repose actuellement sur la co-transduction de 4 vecteurs lentiviraux dans les cellules hôtes. Pour une application
chez l'homme, son application nécessite un système efficace de vectorisation de macromolécules sans intégration virale, plus sûr que
l'utilisationde vecteurs viraux. Dans ce contexte nous voulons développer une nouvelle approche pour la réparation cardiaque qui utilise la
vectorisation de macromolécules protéiques directement dans le noyau de cellules de la paroi lésée du myocarde. Nous avons émis l'hypothèse
que l'injection de 3 facteurs de transcriptions sous forme protéiques via des vecteurs synthétiques serait une alternative efficace et plus sûre pour
générer de nouvelles fibres musculaires au sein de l'infarctus, par rapport aux techniques de vectorisations actuelles. Pour cela, nous utiliserons
les vecteurs synthétiques développés par l'équipe du Dr B. Pitard pour la thérapie génique (U915 IRT-UN Nantes) afin de délivrer des protéines.
Dans une première étape in vitro nous validerons l'aptitude des vecteurs synthétiques à délivrer des macromolécules protéiques dans le noyau des
fibroblastes cardiaques. Dans un second temps, l'aptitude des vecteurs synthétiques à délivrer des protéines directement dans le noyau in vivo
dans la zone cardiaque lésée d'un modèle d'IM par ligature coronaire chez le rat. Nos objectifs sont d'étudier l'efficacité de vectorisation de
macromolécules protéiques directement dans le noyau de cellules de la paroi lésée du myocarde par l'intermédiaire de vecteurs synthétiques par
rapport aux techniques actuelles. A plus long terme, nous voulons véhicule
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Distorsions des hélices-alpha: application à la modélisation
des protéines membranaires
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Distortions of alpha-helices and molecular modeling of transmembrane proteins
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : CHABBERT Marie
% d'encadrement (minimum 40%) : 100
Mail du directeur de thèse : marie.chabbert@univ-angers.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0241735873
Fax du directeur de thèse : 0241735895
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : UMR CNRS 6214 - INSERM U771
Nom et prénom du responsable du laboratoire : HENRION Daniel
Nom et prénom du responsable de l'équipe : CHABBERT Marie
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
:
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Les protéines membranaires permettent la transmission de signaux
ou de molécules à travers la membrane et constituent des cibles thérapeutiques de choix par leur accessibilité. La majorité de ces protéines a une
structure en hélice-alpha. Elles se différentient des protéines solubles par les nombreuses distorsions de ces hélices par rapport à la structure en
hélice-alpha canonique. Ces distorsions jouent un rôle structural majeur et peuvent être impliquées au niveau fonctionnel. La capacité à prédire la
position et la structure de ces distorsions constituerait une aide majeure pour la modélisation des protéines transmembranaires. Le but de cette
thèse est d'apporter une meilleure compréhension des distorsions des hélices transmembranaires, afin de développer des outils prédictifs pour la
modélisation moléculaire. L'approche combinera (1) l'analyse systématique de motifs structuraux par criblage de la Protein Data Bank et la
comparaison des motifs trouvés dans les protéines solubles et membranaires, (2) le développement de programmes prédictifs de cassures, en
particulier au niveau des prolines et (3) l'étude phylogénétique de familles de protéines transmembranaires d'intérêt, afin de comprendre les
mécanismes pilotant l'évolution des distorsions et les changements fonctionnels liés. L'application à la modélisation moléculaire portera sur
diverses familles de protéines membranaires (récepteurs couplés aux protéines G, canaux ioniques...).
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Modèle épidémiologique spatio-temporel en métapopulation
: application au virus de la diarrhée virale bovine
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Spatio-temporal epidemiological model in metapopulation: application to the bovine viral
diarrhea virus
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Ezanno Pauline
% d'encadrement (minimum 40%) : 50
Mail du directeur de thèse : pauline.ezanno@oniris-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0240687854
Fax du directeur de thèse : 0240687768
% d'encadrement : 50
OU
Nom et prénom du co-encadrant : Vergu Elisabeta
% d'encadrement : 50
Mail du co-encadrant : Elisabeta.Vergu@jouy.inra.fr
Téléphone du co-encadrant : 0134652948
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : UMR1300 BioEpAR (INRA, Oniris, Bio-agression, épidémiologie et analyse de risque en
santé animale), Equipe MODEC (modélisation & décision)
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Seegers Henri
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Belloc Catherine
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : La diversité des systèmes d'élevages bovins présents dans une
région et la diversité des contacts entre élevages sont des facteurs majeurs influant la propagation, la persistance et le contrôle des agents
pathogènes dans une métapopulation bovine. Une approche par modélisation est pertinente pour représenter un tel système biologique complexe.
L'objectif de la thèse est de modéliser la propagation d'un agent pathogène dans une métapopulation bovine pour évaluer des stratégies de
maîtrise à une échelle régionale reposant en particulier sur la gestion des flux d'animaux entre troupeaux selon le statut des troupeaux sources
d'animaux. L'application concerne la propagation du virus de la maladie des muqueuses (BVDV), responsable de pertes économiques
importantes pour les éleveurs. Des programmes de maîtrise de sa propagation entre élevages sont développés par les organisations d'éleveurs en
Europe. L'évaluation ex-ante de l'efficacité de stratégies de maîtrise est une attente majeure des professionnels. Il s'agira ici de décrire par
modélisation la propagation du BVDV dans une métapopulation bovine spatialisée, caractérisée par une densité en troupeaux de différents types
interagissant via des mouvements d'animaux et des relations de voisinage. Ce travail intègre une analyse préalable du réseau de contacts entre
troupeaux bovins en France faisant intervenir des notions classiques de la théorie des graphes. Le modèle dynamique stochastique développé
tiendra compte de la diversité des dynamiques d'infection intra-troupeau en couplant des modèles épidémiologiques à l'échelle du troupeau avec
un modèle de propagation d'agents pathogènes sur un réseau de contacts spatialisé. La complexité du modèle global sera à justifier selon la
contribution des voies de transmission inter-troupeau du BVDV à sa propagation régionale. Les prédictions du modèle seront comparées aux
observations réalisées pour différentes stratégies de maîtrise dans le Grand-Ouest de la France.
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : The diversity of the
cattle farming systems located in a region and of between-farm contacts are major factors influencing the spread, persistence and control of
pathogens in a metapopulation of cattle. A modeling approach is adequate to represent such a complex biological system. The objective of the
PhD is to model the spread of a pathogen in a metapopulation of cattle to evaluate control strategies at a regional scale relying on the
management of between-herd animal movements based on herd epidemiological statuses. The application concerns the spread of the bovine viral
diarrhea virus (BVDV), responsible for large economic losses for farmers. Control programs targeting BVDV between-herd spread have been
developed by farmers' organizations in Europe. The ex-ante evaluation of the efficacy of control strategies is therefore a major issue. The PhD
student will model BVDV spread in a spatially explicit metapopulation of cattle, characterized by a density of herds of different types interacting
via animal movements and neighboring relationships. The French cattle network first will be described using graph theory. The stochastic
dynamic model developed will account for the diversity in within-herd infection dynamics by coupling epidemiological models at the herd scale
and a model of pathogen spread on a spatial contact network. The complexity of the resulting model will have to be argued given the relative
contribution of between-herd transmission routes to the BVDV regional spread. Model predictions will be compared with the observations
performed in North-western France under a range of control strategies.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Programmation des maladies cardiovasculaires: influence
des facteurs de risques environnementaux durant la grossesse
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Dr Céline Fassot-Lucht
% d'encadrement (minimum 40%) : 100
Mail du directeur de thèse : celine.fassot@inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0241735878
3. Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : Laboratoire de Biologie Neurovasculaire et Mitochondriale
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Dr Daniel Henrion
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Dr Céline Fassot-Lucht
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5. Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Il est maintenant évident que l'environnement influence fortement
la santé de chacun mais les mécanismes mis en jeu restent largement inconnus. Depuis peu, nous savons que l'expression des gènes peut subir des
modifications importantes et irréversibles avec des effets encore mal connus sur les fonctions clé de l'organisme. C'est en particulier le cas des
modifications épigénétiques induites lors de la grossesse par des facteurs de risque tels que le diabète maternel, l'obésité ou l'hypertension
artérielle. Bien que les complications de ces grossesses à risque soient bien connues, peu d'informations sont disponibles sur le devenir à long
terme des enfants nés lors de ces grossesses notamment en termes de pathologie cardiovasculaire. Cependant, des données tant épidémiologiques
qu'expérimentales suggèrent fortement que des modifications de l'environnement intra-utérin entraîneraient des anomalies fœtales responsables
d'une programmation in utero des maladies cardiovasculaires. L'objectif du présent projet vise à déterminer les mécanismes moléculaires et
cellulaires modifiés avec pour but d'identifier différents gènes responsables et de déterminer les mécanismes physiologiques perturbés au point
d'induire une dégradation du système cardiovasculaire. Les animaux issus de mères soumises aux différents facteurs de risque seront soit étudiés
immédiatement sur le plan génique afin d'étudier les gènes affectés (étude de transcriptome), soit suivis durant toute leur vie afin de déterminer
les paramètres cardiovasculaires et métaboliques modifiés. La fonction vasculaire sera alors étudiée in vitro afin de trouver les cibles
thérapeutiques les plus pertinentes. Ce projet s'inscrit dans un contexte de recherche à enjeu important à la fois dans le domaine de la recherche
fondamentale mais également dans le domaine de la santé publique et de la recherche médicale.
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Norovirus et coquillages : approche de l'évaluation de la
persistance et du pouvoir infectieux.
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Norovirus and shellfish: a study on viral persistence and infectivity evaluation.
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Le Guyader F. Soizick
% d'encadrement (minimum 40%) : 60%
Mail du directeur de thèse : sleguyad@ifremer.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0240374052
Fax du directeur de thèse : 0240374027
Le cas échéant
Nom et prénom du co-directeur (obligatoirement HDR) : Le Pendu jacques
Mail du co-directeur : jlependu@nantes.inserm.fr
Téléphone du co-directeur : 0228080317
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : Ifremer, Laboratoire de Microbiologie LNR
Nom et prénom du responsable du laboratoire : S.F. Le Guyader
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Lors de travaux antérieurs nous avons montré que l'huître, par la
présence de composé glycannique dans certains de ses tissus peut concentrer sélectivement certaines souches de norovirus, éventuellement de
manière saisonnière selon les souches virales. Les ligands caractérisés, présentant de nombreux points communs avec ceux observés pour ces
mêmes virus chez l'homme, expliquent la rapidité de la contamination, la persistance et l'échec de la purification des coquillages. Par contre de
nombreuses questions persistent et ce travail comportera deux axes principaux de recherche: 1/ implication de ces ligands dans la persistance des
particules virales, évaluation du rôle des hémocytes, réponse de l'huître et impact de sa physiologie, 2/ les norovirus ne pouvant être multipliés en
culture, l'intérêt potentiel d'autres Calicivirus (recovirus, RHDV) présentant des similitudes de reconnaissance glycanniques et permettant
d'évaluer le pouvoir infectieux en culture cellulaire ou in vivo (modèle animal) sera considéré. Ce travail est important pour une meilleure
compréhension de la contamination virale des coquillages. Les résultats auront un impact direct sur la gestion des zones contaminées par les
norovirus, agents majeurs des épidémies liées à la consommation d'huîtres à l'heure actuelle. Ce travail, intégré aux projets de recherche du
laboratoire (nationaux ou européens), se fera en collaboration avec l'INSERM (Nantes) et les collaborateurs étrangers (Baylor College of
Medecine, Houston, et Université de Cincinnati, USA).
Projet de thèse en anglais
(document facultatif destiné à un affichage bilingue des sujets sur le site de l'ED, limité à 2000 caractères espaces compris) : Our recent work
showed that oysters, sharing some carbohydrate structures with human norovirus ligands may concentrate selectively some strains, in various
tissues. For some strains seasonal variations have been observed, impacting bioaccumulation efficiency. These ligands, very similar to those
observed in humans, explain some observations such as the rapid contamination of oysters, long persistence and depuration failure. However,
many questions remain and the project will consider two main aspects: 1/ ligands implication in viral persistence, behavior in haemocyte, oyster
gene expression modification and physiological impact, 2/ norovirus being non culturable, is it possible to use other Caliciviruses (recovirus,
RHDV), sharing similar carbohydrate ligands, to evaluate infectivity persistence through cell culture or in vivo assay (animal model) after oyster
bioaccumulation. This work will be important to get a more complete picture of shellfish contamination by norovirus, main pathogens implicated
in shellfish borne outbreaks. Results will have a direct impact on management of contaminated area and will help to improve sanitary quality.
This work will be done in collaboration with INSERM (Nantes), Baylor College of Medicine (Houston Tx) and University of Cincinnati (USA).
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Formes mutées de JAK2: structure, interactions protéine-
protéine, fonction, conséquences pour la cellule et pour l'hémat
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Hermouet Sylvie
% d'encadrement (minimum 40%) : 100%
Mail du directeur de thèse : sylvie.hermouet@univ-nantes.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0643801405
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : INSERM U892
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Bonneville Marc
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Jacques Yannick et Hermouet Sylvie
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : Bergeman Jonathan
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Master Biosignalisation cellulaire et moléculaire et physiopathologie, Université Angers
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Nous étudions les syndromes myéloprolifératifs (SMP). Ces
maladies hématologiques malignes sont caractérisées par la production exagérée de cellules myéloïdes. En 2005, il a été découvert que la
majorité des patients atteints de SMP sont porteurs de la mutation activatrice V617F de JAK2, une tyrosine kinase essentielle pour la
transmission de signal des cytokines et donc pour la prolifération des cellules hématopoïétiques. Depuis, d'autres mutations de JAK2 ont été
identifiées chez les patients souffrant de SMP ou de leucémie aigüe (LA). Notre équipe, à l'aide de techniques sensibles (PCR quantitatives
allèle-spécifiques, high resolution melting (HRM) curve analysis), a mis en évidence de nouvelles mutations de JAK2, dont nous avons
commencé l'étude. Ainsi nous avons montré que JAK2V617F et un nouveau double mutant, JAK2L611V/V617F, activent des voies de
signalisation différentes et sont associées à des présentations cliniques distinctes (Leukemia 2010). Le projet de recherche proposé est de
comprendre les conséquences des différentes mutations de JAK2 identifiées chez les patients. Dans cet objectif, nous recherchons une éventuelle
modification de structure de la molécule, de son activation et de ses interactions avec les récepteurs de cytokines (Epo-R, MPL, autres) et les
molécules STAT. Nous étudierons les conséquences des mutations de JAK2 in vivo, sur les cellules de patients et sur des lignées transfectées
(études de la production de cytokines ; expression et localisation des récepteurs ; survie et prolifération des cellules; amplification du clone
muté), sur l'hématopoïèse (amplification anormale de lignée(s) hématopoïétique(s)) et sur la présentation clinique et l'évolution de la maladie
chez les patients (SMP, LA). Ce projet s'appuie sur le réseau européen MPN&MPNr-EuroNet, dédié aux SMP, coordonné par le directeur de
thèse (voir website: www.mpneuronet.eu). Les méthodes utilisées sont: mutagénèse dirigée,PCR,HRM,clonage,séquençage,transfection,Western
1. Sujet
Intitulé français du sujet de thèse proposé (limité à 120 caractères espaces compris) : Evaluation de la combinaison de drogues épigénétiques
pour le traitement du mésothéliome pleural malin.
Intitulé anglais du sujet de thèse proposé (facultatif) : Evaluation of epigenetic drugs combinations to treat malignant pleural mesothelioma.
2. Encadrement
Nom et prénom du directeur de thèse (obligatoirement HDR) : Gregoire Marc
% d'encadrement (minimum 40%) : 40
Mail du directeur de thèse : marc.gregoire@nantes.inserm.fr
Téléphone du directeur de thèse : 0228080237
Fax du directeur de thèse : 0228080204
% d'encadrement : 60
OU
Nom et prénom du co-encadrant : Blanquart Christophe
% d'encadrement : 60
Mail du co-encadrant : christophe.blanquart@inserm.fr
Téléphone du co-encadrant : 0228080238
Fax du co-encadrant : 0228080204
3.Laboratoire d'accueil
Intitulé (avec identification de l'équipe s'il y a lieu) : INSERM U892-Equipe 4
Nom et prénom du responsable du laboratoire : Bonneville Marc
Nom et prénom du responsable de l'équipe : Gregoire Marc
4.Etudiant pressenti (s'il y a lieu)
Nom et prénom : Baucher Estelle
Intitulé du Master suivi et Université de rattachement : Biologie Agro-Santé mention Sciences Cellulaires et Moléculaires du Vivant.
5.Projet de thèse (sera mise en ligne sur le site web de l'ED)
Saisir ou copier coller ci-dessous (limité à 2000 caractères espaces compris) : Le mésothéliome pleural malin (MPM) est une tumeur très
agressive de la plèvre. Les moyens diagnostics actuels ne permettent la détection du MPM qu'à un stade avancé de la maladie, entrainant ainsi
une prise en charge thérapeutique tardive et moins efficace. Les manques de moyens thérapeutiques efficaces font du MPM un des cancers ayant
un des plus mauvais pronostic. Depuis peu, il a été montré que les drogues épigénétiques, dont le but est de corriger les modifications de la
méthylation de l'ADN ou de l'acétylation des histones observées dans les cellules tumorales, pouvaient être très efficaces en termes de
cytotoxicité pour un certain nombre de cancer. Plusieurs de ces composés (Vorinostat, Décitabine,...) font actuellement l'objet d'essais cliniques.
Cependant, ces drogues présentent certaines limites comme leur manque de spécificité et leur toxicité. Très peu d'études, concernant ces
composés, s'intéressent aux propriétés immunes de la mort cellulaire induite à l'issue de ces traitements. Nous avons montré au laboratoire, que le
traitement iHDAC (Vorinostat) avec un inhibiteur de la méthylation de l'ADN (Décitabine) favorise l'induction de l'apoptose mais aussi, que ce
traitement augmente l'expression d'antigènes de tumeurs permettant ainsi la reconnaissance et la lyse des cellules tumorales par un clone de
lymphocyte T. De plus, dans un modèle murin de mésothéliome, nous avons observé que le traitement Vorinostat-Décitabine réduit la taille de la
tumeur et induit une infiltration de lymphocytes dirigés contre les cellules tumorales. Le projet de thèse consistera 1) à valider et d'améliorer la
mise en place d'une réponse immunitaire contre la tumeur suite à un traitement avec une combinaison d'iHDAC et d'inhibiteurs de la méthylation
de l'ADN et 2) de développer un nouveau mode de vectorisation des drogues épigénétiques afin de mieux cibler la tumeur dans le but de
diminuer leur toxicité et ainsi d'augmenter leur efficacité clinique.