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					Sequences of GenBank accession nos. aj494866-aj494915 and aj408300-50 were obtained from
refs. 2 and 17, respectively, and include only ama1 domains 1 to 3 sequences. ND, not available

Isolates    Origin                   Haplotype                           clusters (k=6)

                              Domain I-III SNPs all SNPs    Domain I-III SNPs all SNPs
Jan-s553    Mali              Hap_87              Hap_68 POP1                 POP1
m2          Mali              Hap_77              Hap_22 POP1                 POP1
p13         Mali              Hap_77              Hap_22 POP1                 POP1
s35         Mali              Hap_77              Hap_22 POP1                 POP1
3D7         The Netherlands   Hap_29              Hap_2 POP1                  POP1
713         Guinea Bissau     Hap_29              Hap_2 POP1                  POP1
105-7       Sudan             Hap_29              Hap_2 POP1                  POP1
aj408332    Nigeria           Hap_29              ND      POP1                ND
aj408338    Nigeria           Hap_29              ND      POP1                ND
413-1       Brazil            Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
hz357       Brazil            Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
pad         Brazil            Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
ecp         Brazil            Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
pc09        Peru              Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
pc15        Peru              Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
pc17        Peru              Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
pc26        Peru              Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
pc49        Peru              Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
1905        PNG               Hap_78              Hap_29 POP1                 POP1
Oct-s131    Mali              Hap_90              Hap_92 POP1                 POP1
fab9        S.Africa          Hap_75              Hap_17 POP1                 POP1
fab6        S.Africa          Hap_75              Hap_5 POP1                  POP1
c2a         Thailand          Hap_58              Hap_39 POP1                 POP1
aj494885    Thailand          Hap_58              ND      POP1                ND
aj494893    Thailand          Hap_58              ND      POP1                ND
mr80        Vietnam           Hap_79              Hap_51 POP1                 POP1
d10         PNG               Hap_74              Hap_103 POP1                POP1
aj494884    Thailand          Hap_57              ND      POP1                ND
aj494887    Thailand          Hap_57              ND      POP1                ND
449         Gambia            Hap_25              Hap_11 POP1                 POP1
aj408326    Nigeria           Hap_25              ND      POP1                ND
Jan-s262    Mali              Hap_25              Hap_62 POP1                 POP1
Jan-s836    Mali              Hap_25              Hap_74 POP1                 POP1
aj408323    Nigeria           Hap_23              ND      POP1                ND
Jan-s1066   Mali              Hap_81              Hap_53 POP1                 POP1
Oct-s137    Mali              Hap_81              Hap_53 POP1                 POP1
Jan-s1135   Mali              Hap_83              Hap_57 POP1                 POP1
aj408334    Nigeria           Hap_31              ND      POP1                ND
Jan-s584    Mali              Hap_31              Hap_69 POP1                 POP1
433         Gambia            Hap_89              Hap_9 POP1                  POP1
aj408330    Nigeria           Hap_27              ND      POP1                ND
Jan-s1051   Mali              Hap_80              Hap_52 POP1                 POP1
aj494895    Thailand          Hap_63              ND      POP1                ND
aj408311    Nigeria           Hap_11              ND      POP1                ND
kmvii       Kenya             Hap_76              Hap_19 POP1                 POP1
Oct-s595    Mali              Hap_76              Hap_19 POP1                 POP1
aj408304    Nigeria           Hap_5               ND      POP1                ND
aj408339    Nigeria           Hap_5               ND      POP1                ND
434         Gambia            Hap_73              Hap_10 POP1                 POP1
Jan-s1134   Mali              Hap_82              Hap_56 POP1                 POP1
Jan-s167    Mali              Hap_84              Hap_61 POP1                 POP1
Jan-s549    Mali              Hap_86              Hap_67 POP1                 POP1
aj408314    Nigeria           Hap_14              ND      POP1                ND
Jul-s21     Mali              Hap_88              Hap_77 POP1                 POP1
aj408344    Nigeria           Hap_39              ND      POP1                ND
gb4         Ghana             Hap_26              Hap_16 POP1                 POP1
aj408329    Nigerian          Hap_26              ND      POP1                ND
aj494866    Thailand          Hap_46              ND      POP1                ND
aj494870    Thailand          Hap_46              ND      POP1                ND
aj494903    Thailand          Hap_46              ND      POP1                ND
aj494908    Thailand          Hap_46              ND      POP1                ND
aj494914    Thailand          Hap_46              ND      POP1                ND
p98-5       Thailand          Hap_52              Hap_46 POP1                 POP1
aj494875    Thailand          Hap_52              ND      POP1                ND
aj494897    Thailand          Hap_52              ND      POP1                ND
aj494902    Thailand          Hap_52              ND      POP1                ND
Jan-s1093   Mali              Hap_133             Hap_55 POP1                 POP4
Oct-s756    Mali              Hap_113             Hap_100 POP1                POP3
aj494912    Thailand          Hap_71              ND      POP1                ND
Jan-s423    Mali              Hap_85              Hap_65 POP1                 POP1
aj408340    Nigeria           Hap_35              ND      POP1                ND

hz395       Brazil            Hap_101             Hap_33    POP2              POP2
aj408302    Nigeria           Hap_3               ND        POP2              ND
div14       Brazil            Hap_100             Hap_32    POP2              POP2
hz475       Brazil            Hap_100             Hap_32    POP2              POP2
Jan-s837    Mali              Hap_107             Hap_75    POP2              POP2
aj408349    Nigeria           Hap_44              ND        POP2              ND
Oct-s1075   Mali              Hap_112             Hap_90    POP2              POP2
Oct-s167    Mali              Hap_112             Hap_94    POP2              POP2
224         Gambia            Hap_32              Hap_6     POP2              POP2
camp        Malaysia          Hap_32              Hap_6     POP2              POP2
aj408335    Nigeria           Hap_32              ND        POP2              ND
Jul-s687    Mali              Hap_109             Hap_82    POP2              POP2
ecu         Ecuador           Hap_102             Hap_34    POP2              POP2
128-4       Sudan             Hap_97              Hap_27    POP2              POP2
m190        Gambia            Hap_94              Hap_14    POP2              POP2
9016        Ghana             Hap_98              Hap_3     POP2              POP2
aj408319    Nigeria           Hap_19              ND        POP2              ND
Jul-s725    Mali              Hap_110             Hap_83    POP2              POP2
aj494899    Thailand          Hap_64              ND        POP2              ND
Oct-s1017   Mali              Hap_111             Hap_88    POP2              POP2
99-3        Thailand          Hap_55              Hap_38    POP2              POP2
p98-11      Thailand          Hap_55              Hap_38    POP2              POP2
p98-18        Thailand       Hap_55    Hap_38 POP2    POP2
p98-4         Thailand       Hap_55    Hap_38 POP2    POP2
v1/s          Vietnam        Hap_55    Hap_38 POP2    POP2
aj494891      Thailand       Hap_55    ND      POP2   ND
aj494915      Thailand       Hap_55    ND      POP2   ND
aj408341      Nigeria        Hap_36    ND      POP2   ND
aj408331      Nigeria        Hap_28    ND      POP2   ND
aj494877      Thailand       Hap_54    ND      POP2   ND
aj408307      Nigeria        Hap_7     ND      POP2   ND
png3          PNG            Hap_93    Hap_107 POP2   POP2
mt-s1         Thailand       Hap_104   Hap_44 POP2    POP2
k1            Asia           Hap_103   Hap_43 POP2    POP2
Oct-s839      Mali           Hap_103   Hap_43 POP2    POP2
569-1         Brazil         Hap_99    Hap_30 POP2    POP2
Jul-s1017     Mali           Hap_108   Hap_76 POP2    POP2
Jan-s137      Mali           Hap_105   Hap_59 POP2    POP2
Oct-s532      Mali           Hap_105   Hap_59 POP2    POP2
Oct-s1023     Mali           Hap_105   Hap_59 POP2    POP2
Jan-s65       Mali           Hap_106   Hap_70 POP2    POP2
aj494876      Thailand       Hap_53    ND      POP2   ND
SL/D6         Sierra Leone   Hap_96    Hap_24 POP2    POP2
aj408345      Nigeria        Hap_40    ND      POP2   ND
m97           Gambia         Hap_95    Hap_15 POP2    POP2
aj408315      Nigeria        Hap_15    ND      POP2   ND
aj408318      Nigeria        Hap_18    ND      POP2   ND
aj494906      Thailand       Hap_68    ND      POP2   ND
1917          PNG            Hap_92    Hap_102 POP2   POP2
tha2-2        Thailand       Hap_48    Hap_49 POP2    POP6
aj494868      Thailand       Hap_48    ND      POP2   ND
aj494883      Thailand       Hap_48    ND      POP2   ND

png13         PNG            Hap_47    Hap_105 POP3   POP3
png9-1        PNG            Hap_47    Hap_105 POP3   POP3
aj494867      Thailand       Hap_47    ND      POP3   ND
aj494878      Thailand       Hap_47    ND      POP3   ND
aj494898      Thailand       Hap_47    ND      POP3   ND
Jul-s434      Mali           Hap_121   Hap_79 POP3    POP3
Jul-s857      Mali           Hap_121   Hap_85 POP3    POP3
aj408346      Nigeria        Hap_41    ND      POP3   ND
Oct-s626      Mali           Hap_127   Hap_99 POP3    POP3
aj408308      Nigeria        Hap_8     ND      POP3   ND
Oct-s1051     Mali           Hap_124   Hap_89 POP3    POP3
Jul-s808      Mali           Hap_123   Hap_84 POP3    POP3
Jan-s807      Mali           Hap_120   Hap_73 POP3    POP3
102-1         Sudan          Hap_114   Hap_25 POP3    POP3
124-8         Sudan          Hap_114   Hap_25 POP3    POP3
123-5         Sudan          Hap_115   Hap_26 POP3    POP3
aj494886      Thailand       Hap_59    ND      POP3   ND
p98-13        Thailand       Hap_49    Hap_45 POP3    POP3
aj494869      Thailand       Hap_49    ND      POP3   ND
aj494872      Thailand       Hap_49    ND      POP3   ND
9021          Ghana          Hap_117   Hap_4 POP3     POP3
thy16         Thailand       Hap_119   Hap_50 POP3    POP3
t2/c6         Thailand       Hap_132   Hap_47 POP3    POP4
hb3           Honduras       Hap_131   Hap_36 POP3    POP4
Jan-s738      Mali           Hap_148   Hap_72 POP3    POP6
m5            Mali           Hap_141   Hap_23 POP3    POP5

aj494910      Thailand       Hap_69    ND      POP4   ND
lf4/1 (L32)   Liberia        Hap_16    Hap_21 POP4    POP4
aj408316      Nigeria        Hap_16    ND      POP4   ND
aj408317      Nigeria        Hap_17    ND      POP4   ND
Jul-s532      Mali           Hap_122   Hap_80 POP4    POP3
aj494892      Thailand       Hap_62    ND      POP4   ND
aj494894      Thailand       Hap_62    ND      POP4   ND
aj494901      Thailand       Hap_66    ND      POP4   ND
aj408306      Nigeria        Hap_6     ND      POP4   ND
Oct-s292      Mali           Hap_126   Hap_96 POP4    POP3
Oct-s133      Mali           Hap_125   Hap_93 POP4    POP3
Oct-s422      Mali           Hap_125   Hap_93 POP4    POP3
Oct-s420      Mali           Hap_125   Hap_93 POP4    POP3
indo          Indochina      Hap_60    Hap_41 POP4    POP1
aj494888      Thailand       Hap_60    ND      POP4   ND
aj408333      Nigeria        Hap_30    ND      POP4   ND
Jan-s1145     Mali           Hap_1     Hap_58 POP4    POP4
aj408300      Nigeria        Hap_1     ND      POP4   ND
aj408350      Nigeria        Hap_45    ND      POP4   ND
aj494874      Thailand       Hap_51    ND      POP4   ND
dd2           Indochina      Hap_118   Hap_42 POP4    POP3
thy19         Thailand       Hap_118   Hap_42 POP4    POP3
Jan-s521      Mali           Hap_118   Hap_66 POP4    POP3
aj494911      Thailand       Hap_70    ND      POP4   ND
aj408321      Nigeria        Hap_21    ND      POP4   ND
aj494913      Thailand       Hap_72    ND      POP4   ND
aj494900      Thailand       Hap_65    ND      POP4   ND
aj408337      Nigeria        Hap_34    ND      POP4   ND
png2          PNG            Hap_140   Hap_106 POP4   POP4
png4          PNG            Hap_140   Hap_106 POP4   POP4
Oct-s824      Mali           Hap_91    Hap_101 POP4   POP2
aj494880      Thailand       Hap_56    ND      POP4   ND
aj494881      Thailand       Hap_56    ND      POP4   ND
tha18-1       Thailand       Hap_61    Hap_48 POP4    POP4
aj494890      Thailand       Hap_61    ND      POP4   ND
aj494896      Thailand       Hap_61    ND      POP4   ND
aj494905      Thailand       Hap_61    ND      POP4   ND
aj494909      Thailand       Hap_61    ND      POP4   ND

Oct-s584      Mali           Hap_13    Hap_98 POP5    POP5
aj408313      Nigeria        Hap_13    ND     POP5    ND
aj408324    Nigeria    Hap_13    ND       POP5   ND
aj408312    Nigeria    Hap_12    ND       POP5   ND
m24         Kenya      Hap_129   Hap_20   POP5   POP5
haiti       Haiti      Hap_130   Hap_35   POP5   POP5
Oct-s100    Mali       Hap_136   Hap_87   POP5   POP5
Oct-s1090   Mali       Hap_137   Hap_91   POP5   POP5
Oct-s540    Mali       Hap_138   Hap_97   POP5   POP5
Jan-s714    Mali       Hap_135   Hap_71   POP5   POP5
Oct-s1092   Mali       Hap_135   Hap_71   POP5   POP5
k39         Kenya      Hap_128   Hap_18   POP5   POP5
aj408342    Nigeria    Hap_37    ND       POP5   ND
aj408320    Nigeria    Hap_20    ND       POP5   ND
Jan-s128    Mali       Hap_134   Hap_60   POP5   POP5
106         Sudan      Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
fcr3        Asia       Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
fvo         Asia       Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
jck         Cambodia   Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
par         Asia       Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
thai2-1     Thailand   Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
tm284       Thailand   Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
d5          SE Asia    Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
p31         Asia       Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
png5-1      PNG        Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
png9-3      PNG        Hap_50    Hap_1    POP5   POP2
aj494871    Thailand   Hap_50    ND       POP5   ND
aj494873    Thailand   Hap_50    ND       POP5   ND
aj494882    Thailand   Hap_50    ND       POP5   ND
aj494889    Thailand   Hap_50    ND       POP5   ND
aj494907    Thailand   Hap_50    ND       POP5   ND

aj408322    Nigeria    Hap_22    ND      POP6    ND
aj408328    Nigeria    Hap_22    ND      POP6    ND
Jan-s305    Mali       Hap_22    Hap_63 POP6     POP6
Oct-s132    Mali       Hap_22    Hap_63 POP6     POP6
Jul-s300    Mali       Hap_22    Hap_78 POP6     POP6
aj408347    Nigeria    Hap_42    ND      POP6    ND
aj408325    Nigeria    Hap_24    ND      POP6    ND
Jul-s541    Mali       Hap_149   Hap_81 POP6     POP6
aj408310    Nigeria    Hap_10    ND      POP6    ND
aj408348    Nigeria    Hap_43    ND      POP6    ND
aj408303    Nigeria    Hap_4     ND      POP6    ND
png10-1     PNG        Hap_139   Hap_104 POP6    POP5
9915        Thailand   Hap_67    Hap_37 POP6     POP6
tm191c      Thailand   Hap_67    Hap_37 POP6     POP6
aj494904    Thailand   Hap_67    ND      POP6    ND
601         Gambia     Hap_2     Hap_13 POP6     POP5
9013        Gambia     Hap_2     Hap_13 POP6     POP5
Jan-s396    Mali       Hap_2     Hap_64 POP6     POP5
Aj408301    Nigeria    Hap_2     ND      POP6    ND
aj408305    Nigeria    Hap_2     ND      POP6    ND
aj408327    Nigeria    Hap_2     ND      POP6    ND
jav         Cambodia   Hap_143   Hap_40 POP6     POP5
aj408309    Nigeria    Hap_9     ND      POP6    ND
Oct-s285    Mali       Hap_150   Hap_95 POP6     POP6
418         Gambia     Hap_144   Hap_7 POP6      POP5
ren         Sudan      Hap_142   Hap_28 POP6     POP5
aj408343    Nigeria    Hap_38      ND    POP6    ND
7g8         Brazil     Hap_116   Hap_31 POP6     POP3
div17       Brazil     Hap_116   Hap_31 POP6     POP3
div30       Brazil     Hap_116   Hap_31 POP6     POP3
hz597       Brazil     Hap_116   Hap_31 POP6     POP3
hz945       Brazil     Hap_116   Hap_31 POP6     POP3
ics         Brazil     Hap_116   Hap_31 POP6     POP3
Jul-s954    Mali       Hap_145   Hap_86 POP6     POP5
Oct-s425    Mali       Hap_145   Hap_86 POP6     POP5
456         Gambia     Hap_146   Hap_12 POP6     POP6
Jul-s24     Mali       Hap_146   Hap_12 POP6     POP6
425         Gambia     Hap_146   Hap_8 POP6      POP6
hu425       Gambia     Hap_146   Hap_8 POP6      POP6
Jan-s1070   Mali       Hap_147   Hap_54 POP6     POP6
aj408336    Nigeria    Hap_33    ND      POP6    ND

				
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posted:12/1/2011
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